文献类型： 中文期刊
作者： 史建磊 1 ; 万红建 2 ; 熊自立 1 ; 张海利 1 ; 马彦如 1 ; 苏世闻 1 ; 宰文珊 1 ;
作者机构： 1.温州科技职业学院温州市农业科学研究院浙南作物育种重点实验室
2.浙江省农业科学院蔬菜研究所
关键词： Mlo基因家族;生物信息学;基因重复;系统聚类;同源基因
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2020 年 39 卷 008 期
页码： 3541-3553
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： Mlo作为一类广谱抗病因子,参与植物多种生物与非生物胁迫反应.为研究不同物种Mlo基因的基本特征及进化关系,选取己测序的29种代表性植物,利用生物信息学方法对其进行鉴定及系统进化分析.结果 显示:共有198个植物Mlo基因被鉴定,各基因具有11~14个外显子,编码400~600个氨基酸,翻译碱性疏水性稳定蛋白,部分Mlo含信号肽和钙调素结合区,绝大多数Mlo定位于细胞膜,含5~7个跨膜螺旋结构.基序分析发现,10个保守基序长21~50个氨基酸.染色体定位发现174个Mlo不均衡地散布于不同染色体或scaffold上,且主要位于两端,形成19个(24.1%)基因簇、5对(5.7%)串联重复和61对(36.2%)片段重复.系统聚类可将164个Mlo分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三个区组,被子植物Mlo主要聚在ⅠA组,江南卷柏Mlo聚在ⅠA和ⅢB组,小立碗藓Mlo聚在ⅠB和ⅢA组,几乎所有藻类Mlo聚在Ⅱ组.同源性分析发现52.4%的Mlo以同源基因形式存在,包括25对直系同源基因和28对旁系同源基因,其Ka/Ks值为0.01~0.78,说明进化中主要受到纯化选择.研究表明植物Mlo基因家族较保守,具有成簇存在的特点,在进化过程中经重复扩张,形成了大量同源基因,同时也发生了不同程度的丢失,结果为相关基因分离及植物抗病育种应用提供了理论依据.
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