文献类型: 中文期刊
作者: 姚全胜 1 ; 杨倩 1 ; 柳凤 1 ; 詹儒林 1 ;
作者机构: 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所海南省热带园艺产品采后生理与保鲜重点实验室农业部热带果树生物学重点实验室
关键词: 芒果细菌性角斑病菌;侵染;实时荧光定量聚合酶链式扩增反应;内参基因
期刊名称: 分子植物育种
ISSN:
年卷期: 2021 年 018 期
页码: 6088-6095
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为筛选芒果细菌性角斑病菌在侵染芒果叶片过程中稳定表达的内参基因,采用实时荧光定量聚合酶链式扩增反应技术检测和分析病原细菌的16S rRNA、gyrB、GAPDH、dan K和rpo D这5个看家基因的表达量。结果表明,经过PCR扩增效率筛选,5个基因均扩增出单一条带,且条带大小与预期产物相符,特异性较好,符合基本稳定性要求。利用ge Norm软件分析发现,GAPDH和rpo D稳定性最高,M值均为0.122。其余3个基因的表达稳定性依次为gyr B (M=0.17)>dan K (M=0.325)>16S rRNA (M=0.542)。在5个候选内参基因中,GAPDH和gyr B为病原细菌侵染芒果叶片下表达最稳定的基因,且不需要引入第三个基因(V2/3=0.063)。NormFinder软件分析5个候选内参基因稳定性数值顺序依次为:gyr B (0.092)>dan K (0.169)>GAPDH(0.188)>rpo D (0.235)>16S rRNA (0.581)。Bestkeeper程序分析5个候选内参基因的标准差(SD)值都在0.86~0.79之间。综合以上结果发现GAPDH和gyr B基因的表达稳定性最好,能够作为病原细菌在侵染芒果叶片时的内参基因,更准确地校正定量结果。
- 相关文献
[1]用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析. 魏永赞,赖彪,胡福初,李晓静,胡桂兵,王惠聪. 2011
[2]Fusarium mangiferae对杧果顶芽内活性氧代谢的影响. 柳凤,欧雄常,詹儒林,常金梅,韦继光. 2015
[3]荔枝果皮对不同致病力炭疽菌侵染的结构变化差异. 张新春,彭元科,高兆银,王家保. 2015
[4]Fusarium mangiferae对杧果酚类代谢的影响. 柳凤,欧雄常,詹儒林,韦继光,常金梅. 2015
[5]马铃薯X病毒载体介导的乙肝病毒表面抗原在烟草中的表达. 唐清杰,沈文涛,蔡群芳,卢雅薇,周鹏. 2008
[6]穿刺巴斯德芽菌Ppgh-3对根结线虫侵染的番茄相关生理生化指标的影响. 商桑,田丽波,黄慧琴,朱军,孙前光,鲍时翔. 2016
[7]香蕉枯萎病菌1号和4号生理小种菌株侵染和定殖巴西蕉和粉蕉根系的观察. 郭立佳,梁昌聪,张建华,杨腊英,王国芬,刘磊,黄俊生. 2013
[8]PVX病毒载体介导2种马铃薯Y病毒科病毒VPg蛋白表达诱导烟草叶片系统坏死的研究. 刘洋,周鹏,庹德财,唐庆华,言普,黎小瑛,沈文涛. 2021
[9]Fusarium mangiferae侵染对芒果矿质元素含量的影响. 柳凤,欧雄常,韦继光,詹儒林,常金梅. 2015
[10]烟草疫霉侵染前后剑麻叶片转录组学研究. 高建明,杨峰,郑金龙,刘巧莲,陈河龙,易克贤. 2014
[11]利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析的方法. 吴建阳,何冰,杜玉洁,李伟才,魏永赞. 2017
[12]用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析. 魏永赞,赖彪,胡福初,李晓静,胡桂兵,王惠聪. 2012
[13]澳洲坚果实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选. 杨倩,杨子平,周娅丽,陈东泉,刘恒. 2020
[14]六点始叶螨内参基因筛选及其在超氧化物歧化酶基因EsSOD表达分析中的应用. 梁晓,陈青,伍春玲,方永军. 2021
[15]基于基因组和转录组数据的胡椒内参基因鉴定. 胡丽松,吴思婷,段兴帅,岑怡,苏岳峰,范睿,伍宝朵,郝朝运. 2020
[16]高温胁迫下瓜实蝇的内参基因筛选. 周世豪,李磊,符悦冠. 2016
[17]数字PCR和荧光定量PCR检测转基因番木瓜中外源基因拷贝数方法的建立及其应用. 谢秀菊,夏启玉,刘帅,麦贤俊,贾瑞宗,郭安平,徐志胜,李峰,孔祥义,赵辉. 2024
[18]温度和药剂胁迫下黄翅绢野螟实时荧光定量PCR内参基因筛选. 孟倩倩,孙世伟,王政,高圣风,苟亚峰,刘爱勤. 2021
[19]秋石斛RT-qPCR内参基因的筛选与验证. 侯天泽,易双双,张志群,王健,李崇晖. 2022
[20]橡胶草实时荧光定量PCR内参基因评价. 覃碧,潘敏,余海洋,杨玉双,甘霖. 2016
作者其他论文 更多>>
-
菠萝Ac4CL5基因的克隆及表达分析
作者:宋康华;洪克前;侯晓婉;谷会;姚全胜
关键词:菠萝;4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL);序列;原核表达;转录调控
-
基于简化基因组技术的33份芒果品种遗传分析
作者:王露露;王磊;姚全胜;周开兵;柳凤
关键词:芒果;简化基因组测序;遗传分析
-
基于全基因重测序的芒果细菌性角斑病抗性相关SNP分析
作者:徐志豪;周思思;詹儒林;姚全胜;柳凤
关键词:全基因组重测序;芒果;细菌性角斑病;单核苷酸多态性
-
澳洲坚果种质资源耐热性调查与分析
作者:万继锋;曾辉;邹明宏;宋喜梅;杨玉春;杨倩;白海东
关键词:澳洲坚果;种质资源;耐热性;热敏感;生理特性;叶绿素
-
绿色荧光蛋白(GFP)标记杧果细菌性角斑病病原菌及其定殖规律
作者:於浩然;吴婧波;詹儒林;柳凤;姚全胜;李国平;魏卿
关键词:杧果细菌性角斑病;野油菜黄单胞菌杧果致病变种Xanthomonas;citri;pv.mangiferaeindicae;GFP标记;质粒;定殖
-
非寄主植物精油对桔小实蝇的驱避效果研究
作者:杨洁;尹伊秀娟;王丽娟;李国平;李裕展;徐建欣;高冠群;詹儒林;王姝逸
关键词:桔小实蝇;精油;非寄主植物;产卵驱避;驱避持效期
-
鳄梨采前果实黑褐色病斑病原鉴定及田间药剂防治
作者:於浩然;吴婧波;詹儒林;姚全胜;李国平;陈晶晶;井敏敏
关键词:黑褐色病斑;油梨炭疽病;刺盘孢;致病性;多基因;防效