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Streptomyces bacillaris ATCC 15855~T中bafilomycin A1合成基因簇的挖掘

文献类型: 中文期刊

作者: 赵守静 1 ; 高坤鹏 1 ; 刘振 1 ; 毛相朝 1 ;

作者机构: 1.中国海洋大学食品科学与工程学院;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋药物与生物制品功能实验室

关键词: Streptomyces bacillaris ATCC 15855~T;全基因组序列;Bafilomycin A1;次级代谢产物;基因簇

期刊名称: 工业微生物

ISSN: 1001-6678

年卷期: 2019 年 06 期

页码: 18-25

摘要: Bafilomycin A1是大环内酯类抗生素,具有广泛的抗癌活性。通过HPLC及HPLC-MS分析Streptomyces bacillaris ATCC 15855~T的发酵产物,结果显示S.bacillaris ATCC 15855~T发酵能够产生bafilomycin A1。S.bacillaris ATCC 15855~T分离自中亚土壤。通过全基因组测序,获得了S.bacillaris ATCC 15855~T的完整基因组序列。该基因组由6 957 417 bp的线性染色体组成,GC含量为72.29%。该染色体预测了7 284个开放阅读框架(ORF),18个rRNA操纵子,64个tRNA基因。通过antiSMASH v 4.0.3分析,共预测了39个生物合成基因簇。其中,具有抑制液泡型H(+)ATP酶的bafilomycin A1基因簇与已报道的基因簇相似度为100%。在bafilomycin A1合成基因簇中有19个ORFs。

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