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叶绿体标记在玉米种质资源快速分组中的应用分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王蕊 1 ; 孙擘 1 ; 张云龙 1 ; 张茗起 1 ; 范亚明 1 ; 田红丽 1 ; 赵怡锟 1 ; 易红梅 1 ; 匡猛 1 ; 王凤格 1 ;

作者机构： 1.北京市农林科学院玉米研究所/农业农村部农作物DNA指纹创新利用重点实验室(部省共建)/玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室

关键词： 玉米;种质资源;叶绿体标记;KASP;分组方案

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2024 年 007 期

页码： 1867-1876

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 叶绿体标记具有遗传保守性高且不受核基因重组干扰等特点,适于对玉米种质资源进行分类管理.本研究基于Maize6H-60K芯片对玉米叶绿体标记筛选获得叶绿体分组候选位点,使用上述位点对3549份玉米种质资源进行聚类分析,将玉米种质资源划分为B、D、H、C、T共5个类群.通过基因型信息对比筛选出29个叶绿体分组特异标记(Varietal Chloroplast Panel,VCP)并设计KASP引物.开发兼容芯片、KASP平台的快速分组分析算法,算法结果与聚类分析一致.挑选5个类群特异位点利用序贯法对种质资源进行快速分组检测,构建玉米种质资源快速分组方法,减少了95%的检测量,为玉米种质资源提供一种新型高效的分组管理方法.

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