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堆肥中微生物总DNA的高效提取

文献类型： 中文期刊

作者： 何丽鸿 1 ; 赵勇 1 ; 陈明杰 2 ; 潘迎捷 1 ;

作者机构： 1.南京农业大学生命科学院微生物学系

2.上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所

关键词： 堆肥;DNA的高效提取;高有机含量;DGGE

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2006 年 46 卷 01 期

页码： 162-165

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用化学裂解和酶解相结合的方法,选择加入PVPP的高盐缓冲液作为细胞裂解的反应体系,并以PEG-8000进行DNA沉淀,从高有机含量的堆肥样品中进行微生物总DNA的提取。结果表明,从4种性质不同的堆肥中均获得了高质量的微生物总DNA,所得的DNA分子片段在23kb左右;每克干重堆肥的总DNA提取量为63.54±12.08μg~106.50±28.36μg,A260/A280大于1.6,A260/A230大于1.8,不用经过纯化可以直接进行PCR扩增和限制性酶切;以该DNA为模板进行微生物区系的DGGE分析,显示了丰富的微生物多样性。该方法减少了通常环境样品DNA提取过程中的纯化步骤,减少了DNA的损失,为从事微生物分子生态学,尤其是那些针对高有机含量以及获取极为不易的环境样品的研究而言是十分有益的。

  • 相关文献

[1]羊肚菌内生细菌DGGE鉴定. 沈洪,陈明杰,赵永昌,潘迎捷. 2008

[2]Impact of beta-carotene transgenic rice with four synthetic genes on rhizosphere enzyme activities and bacterial communities at different growth stages. Li, Peng,Dong, Jiayan,Yang, Shifang,Bai, Lan,Wang, Jinbin,Wu, Guogan,Wu, Xia,Yao, Quanhong,Tang, Xueming,Li, Peng,Dong, Jiayan,Yang, Shifang,Bai, Lan,Wang, Jinbin,Wu, Guogan,Wu, Xia,Yao, Quanhong,Tang, Xueming.

[3]微生物菌剂对茭白秸秆堆肥过程的影响. 徐四新,诸海焘,余廷园,蔡树美. 2018

[4]生物炭调控农业废弃物堆肥过程的研究进展. 张建国,高雅,张继宁,张鲜鲜,孙会峰,王从,周胜. 2023

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