文献类型: 中文期刊
作者: 赵哲 1 ; 任春华 1 ; 江晓 1 ; 张吕平 1 ; 冯娟 2 ; 胡超群 1 ;
作者机构: 1.中国科学院南海海洋研究所
2.中国水产科学研究院南海水产研究所
关键词: 荧光定量PCR;LAMP;IHHNV;特异性;灵敏度
期刊名称: 水生生物学报
ISSN: 1000-3207
年卷期: 2010 年 34 卷 05 期
页码: 984-989
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖对虾的重要病毒性病原之一,给对虾养殖业造成严重经济损失。研究建立了检测IHHNV的荧光定量PCR和环介导等温核酸扩增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)两种技术,并对它们的特异性和灵敏性进行了比较。结果显示,所建立的荧光定量PCR检测IHHNV的方法最低检测限度为6个DNA拷贝/反应,在待扩增DNA浓度为6.038×104-6.038×109cps/mL范围时,模板浓度与循环阈值Ct之间的相关性良好,决定系数r2为0.99521;对5份白斑综合症病毒基因组DNA和10份健康对虾基因组DNA样品进行荧光定量PCR检测,结果都为阴性;这说明荧光定量PCR检测IHHNV方法具有灵敏度高、特异性高和精确性高等优点。同样,所建立的LAMP检测IHHNV的方法在60min反应时间内也可检测到最低为6个拷贝的DNA模板,反应产物加入荧光染料SYBR Green I后反应液呈现明显的亮绿色,且特异的检测IHHNV DNA模板;这说明所建立的LAMP检测IHHNV的方法具有荧光定量PCR方法相当的灵敏度、特异性和精确性。考虑到LAMP检测方法操作更为简单、方便,而且不需要昂贵的仪器,LAMP检测IHHNV的方法更适合于对虾养殖现场检测的推广使用。
- 相关文献
[1]人工培育对虾苗种体内可培养细菌数量及组成分析. 张晓静,宋晓玲,万晓媛,杨冰,黄倢. 2016
[2]对虾6种病毒多重PCR检测方法的建立. 刘飞,张宝存,张晓华,黄倢. 2014
[3]海藻糖对冷冻干燥的LAMP反应体系的保护效果. 李美霞,张庆利,刘利平,黄倢,谢国驷. 2012
[4]海水中副溶血弧菌的可视化LAMP快速检测方法. 黄梦诗,杨倩倩,张艳,谷阳光,赵俊,张旭志,丁东生,曲克明. 2017
[5]白斑综合征病毒(WSSV)3种PCR检测方法的灵敏度比较. 肖广侠,李战军,孟宪红,张庆文,罗坤,孔杰. 2011
[6]An improved method for detection of Edwardsiella tarda by loop-mediated isothermal amplification by targeting the EsrB gene. Xie Guosi,Zhang Qingli,Han Nana,Shi Chengyin,Wang Xiuhua,Liu Qinghui,Huang Jie,Xie Guosi,Huang Jie. 2012
[7]Rapid diagnosis of turbot reddish body iridovirus in turbot using the loop-mediated isothermal amplification method. Zhang, Qingli,Shi, Chenyin,Huang, Jie,Jia, Kuntong,Chen, Xinhua,Liu, Hong. 2009
[8]Recording the Reaction Process of Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) by Monitoring the Voltammetric Response of 2 '-Deoxyguanosine 5 '-Triphosphate. Zhang, Xuzhi,Qu, Keming,Li, Qiufen,Cui, Zhengguo,Zhao, Jun,Sun, Xuemei. 2011
[9]Brief review of monitoring methods for loop-mediated isothermal amplification (LAMP). Zhang, Xuzhi,Lowe, Stuart B.,Gooding, John Justin,Lowe, Stuart B.,Gooding, John Justin.
[10]创伤弧菌多克隆抗体的制备及其特性分析. GU Xiaoli,古小莉,LI Liudong,李刘冬,CHEN Yuexin,陈悦鑫,HUANG Ke. 2015
[11]环介导恒温扩增技术快速检测短凯伦藻. 张凤英,石彦红,马凌波,徐兆礼. 2012
[12]基于牡蛎疱疹病毒DNA聚合酶基因的巢式PCR检测方法的建立及应用. 高文辉,白昌明,蔡生力,王崇明. 2016
[13]大菱鲆(Scophthalmus maximus)PRL基因、Na~+-K~+-ATPase α1基因对盐度胁迫的响应. 崔文晓,马爱军,黄智慧,孙志宾,刘志峰,夏丹丹,唐启政,杨志,曲江波. 2017
[14]仿刺参硫酸软骨素合酶1基因克隆及灿烂弧菌感染后的表达特征模式分析. 谭颜廷,葛建龙,廖梅杰,荣小军,王锦锦,李彬,赵岩峰,王印庚,王璐. 2024
[15]荧光定量PCR数据处理方法的探讨. 唐永凯,贾永义. 2008
[16]合浦珠母贝不同壳基质蛋白基因的表达水平比较. 薛桂英,郭奕惠,黄桂菊,范嗣刚,刘宝锁,喻达辉. 2013
[17]罗非鱼催乳素Ⅰ基因的组织分布及盐胁迫对其表达的影响. 刘玉姣,朱华平,卢迈新,刘志刚,曹建萌,高风英,可小丽. 2014
[18]壬基酚致红鲫发育畸形的机制. 田雨苏,孙远东,欧密,刘雨芳,崔小娟,周定港,车文安,陈昆慈. 2020
[19]同步接毒条件下鳜传染性脾肾坏死病毒在CPB细胞中的最适增殖条件. 罗霞,付小哲,李宁求,林强,张悠,黄志斌. 2015
[20]军曹鱼Igμ重链的全长克隆及在各组织中的定量分析. 侯月娥,冯娟,郭志勋,郭吉余,徐力文,苏友禄. 2012
作者其他论文 更多>>
-
桑沟湾碳酸盐体系的时空变化特征及影响因素
作者:丁怡丹;朱琳;冯娟;隋琪;孙雪梅;赵信国;夏斌;陈碧鹃;曲克明
关键词:桑沟湾;海水养殖;碳酸盐体系;pCO2;FCO2
-
哈氏弧菌345Ⅲ型分泌系统诱导鱼类细胞凋亡和变圆
作者:吴颖;邓益琴;张策;李席席;张晨;梁思轩;徐雪峰;赵哲
关键词:哈氏弧菌;Ⅲ型分泌系统;vcrD基因;细胞凋亡
-
短期投喂石榴皮水提物对花鲈防控杀鱼爱德华氏菌感染的作用
作者:胡建美;马壮;王宝屯;黄伟民;冯娟;苏友禄
关键词:石榴皮;花鲈;杀鱼爱德华氏菌;免疫力
-
维氏气单胞菌重要致病因子基因对环境条件的响应
作者:王茜;邓益琴;孙承文;林梓阳;苏雯晓;刘梦瑶;程长洪;郭志勋;冯娟
关键词:维氏气单胞菌;致病因子;实时荧光定量PCR;温度;pH;转速
-
60种中草药及其复方对杀鱼爱德华氏菌的体外抑菌效果
作者:胡建美;王宝屯;冯娟;许新;苏友禄
关键词:花鲈;杀鱼爱德华氏菌;体外抑菌;中草药
-
贝莱斯芽孢杆菌LG37全基因组测序分析及无机氮代谢相关候选基因的筛选
作者:刘广鑫;董晏君;赵丽娟;邓益琴;程长洪;马红玲;江建军;冯娟;郭志勋;林蠡
关键词:贝莱斯芽孢杆菌;全基因组测序;无机氮;代谢通路
-
cbpD基因对溶藻弧菌毒力及相关生物学特性的影响
作者:苏雯晓;邓益琴;臧树军;王茜;林梓阳;冯娟
关键词:溶藻弧菌;cbpD基因;基因敲除;毒力调控;生物学特性