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高分辨率溶解曲线分析技术在大豆Ecotilling中的应用

文献类型: 中文期刊

作者: 焦丽 1 ; 刘相国 2 ; 杨春明 3 ; 王虎义 4 ; 郝东云 2 ; 王庆钰 1 ;

作者机构: 1.吉林大学植物科学学院

2.吉林省农业科学院生物技术研究中心

3.吉林省农业科学院大豆研究中心

4.吉林大学生命科学学院

关键词: 大豆;高分辨率溶解曲线分析技术;Ecotilling;SNP

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2011 年 30 卷 05 期

页码: 131-134+138

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 将高分辨率溶解曲线(High Resolution Melting,HRM)技术运用在大豆Ecotilling中,对256份栽培大豆的大豆异黄酮合酶基因(IFS1)的外显子区域进行SNP筛查,并采用直接测序的方法对HRM检测结果进行验证。结果表明:模板均一化后的检测效果较未均一化的检测效果差异显著,野生型样本与待测样本按1∶1及1∶4比例混样溶解曲线阈值较高,其中1∶4混样适合高通量检测。HRM对IFS1基因外显子区域的检测结果与PCR产物测序的结果比对显示,对IFS1第5段外显子和第7段外显子检测的准确率分别达到91.2%和100%,表明该研究利用HRM技术建立的栽培大豆的Ecotilling技术体系是一种高灵敏度、高通量和低成本检测SNP的新方法。

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