文献类型： 中文期刊

作者： 张少平 ¹ ; 邱珊莲 ¹ ; 郑云云 ¹ ; 张帅 ¹ ; 吴松海 ¹ ; 何炎森 ¹ ; 郑开斌 ¹ ;

作者机构： 1.福建省农业科学院亚热带农业研究所

关键词： 紫色黄秋葵;转录组基因;测序分析;功能注释

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2017 年 31 卷 04 期

页码： 643-653

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 黄秋葵为药食兼用型植物,富含花青素、多糖、黄酮及萜类等活性成分。为探讨黄秋葵次级代谢过程中这些活性物质合成的遗传基础,以紫色黄秋葵嫩茎叶为材料,采用Illumina Hi Seq 2500高通量转录组测序技术获得23 026 500个短读序,经组装获得42 484个Unigene,平均长度877 bp。31 931个和21 926个Unigene分别在Nr和Swiss Prot数据库有同源比对信息;Unigene与COG、KOG数据库进行比对,根据其功能各分为24类和25类;通过Pfam数据库,所注释到的20 031个Unigene分属于7 277类蛋白结构域;GO注释到18 602个Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程等三大类的51个功能组,其中大量Unigene与细胞部分、细胞、催化活性、结合活性、代谢进程及细胞进程相关;根据KEGG数据库,可将7 619个Unigene定位到119个代谢途径分支,其中有1、3、35、61、13和70个Unigene分属于花色素苷、黄酮、类黄酮、N-多糖、二萜类和萜类骨架生物合成路径,它们可能参与这些活性物质的生物合成。本研究结果为后续深入开展黄秋葵花青素、黄酮类等物质代谢合成途径及相关功能基因研究奠定了基础。