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四引物扩增受阻突变体系PCR技术在中国明对虾SNP基因分型中的研究

文献类型： 中文期刊

作者： 张建勇 1 ; 王清印 2 ; 王伟继 2 ; 孟宪红 2 ; 孔杰 2 ; 张全启 1 ;

作者机构： 1.中国海洋大学海洋生命学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 单核苷酸多态性;基因分型;中国明对虾;四引物扩增受阻突变体系PCR

期刊名称： 中国水产科学

ISSN： 1005-8737

年卷期： 2011 年 18 卷 04 期

页码： 751-759

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用四引物扩增受阻突变体系PCR(Tetra-primer ARMS-PCR)技术,对中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)的80个单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)进行验证。结果表明,通过优化PCR反应条件、调整内外引物浓度和采取Touchdown PCR程序可优化扩增效果,80组引物中有20组引物得到良好的分型效果。群体多态性分析表明有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态性信息含量(PIC)的范围分别为1.127~1.993、0.136~0.607、0.119~0.492和0.145~0.373。结果显示四引物扩增受阻突变体系技术聚合酶链式反应是一种简单快速而有效SNP基因分型的方法。

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