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甜樱桃品种中新多态性SSR的鉴定、指纹图谱构建及聚类分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王晶 1 ; 张开春 1 ; 张晓明 1 ; 闫国华 1 ; 周宇 1 ; 段续伟 1 ; 陈玲 1 ;

作者机构: 1.北京市林业果树科学研究院;农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室;北京市落叶果树工程技术研究中心

关键词: 甜樱桃;SSR;指纹图谱;S基因型

期刊名称: 果树学报

ISSN: 1009-9980

年卷期: 2019 年 12 期

页码: 1619-1629

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】应对迅速增加的甜樱桃品种及其分子鉴定需求,储备一批新多态性SSR,并获得其在甜樱桃品种中的基因型数据。【方法】从甜樱桃基因组测序开发的SSR库中,根据重复单元和重复次数在8条染色体上一共选择了96个SSR。用ABI3730,鉴定出其中9个SSR在4个代表甜樱桃品种中具有多态性。另外从305个李属SSR中又鉴定出9个多态性SSR。用S基因和多态性SSR排除了52个品种122个单株中S基因型不正确和混杂的品种或单株,然后用多态性信息比价高的11个SSR(其中包括8个新SSR)和S基因标记,构建了48个甜樱桃品种的指纹图谱库,并获得了可以区分48个品种的最少标记组合。【结果】聚类分析表明,48个甜樱桃品种组成了短低温组、中国组、北美组和东欧组。聚类分析结果可以和品种间亲缘关系及地域来源互相验证。【结论】鉴定了3个从未报道的甜樱桃品种的S基因型,验证了一种可以有效获得多态性SSR的途径,提供了9个新的多态性SSR及其等位基因大小,用12个分子标记构建了48个甜樱桃品种指纹图谱。本文提供的新SSR及其构建的甜樱桃品种指纹图谱真实可靠。

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