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大口黑鲈MyoD基因结构和单核苷酸多态性位点的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 于凌云 1 ; 白俊杰 1 ; 叶星 1 ; 李胜杰 1 ; 李小慧 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所

关键词: 大口黑鲈;MyoD;SNPs;筛选

期刊名称: 水产学报

ISSN: 1000-0615

年卷期: 2009 年 33 卷 01 期

页码: 1-8

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用PCR技术和基因组步移技术从大口黑鲈基因组DNA中扩增得到MyoD基因及其5′调控区序列。该基因序列全长3 797bp,其中5′调控区长1 077bp,MyoD基因转录区由3个外显子(分别为591、81和78bp)和2个内含子(分别为1 077和486bp)组成。5′调控区含有与肌肉特异性基因转录密切相关的转录调控元件E box、肌细胞增强因子2(MEF2)、肌肉特异性金属硫蛋白结合位点(MTBF)及一些转录反应调控元件(TATA box、OCAAT box、OCT1、PRE、AP4、Pit1)。运用PCR-SSCP技术和直接测序法进行大口黑鲈MyoD基因SNP位点筛选,结果表明MyoD基因序列中存在7个突变点,均位于内含子上。养殖群体中这7个突变点分析结果显示突变比例范围在0.042~0.353之间。本研究结果为SNPs位点与大口黑鲈生长性能关联分析奠定了基础。

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