文献类型： 中文期刊

作者： 孟丽 ¹ ; 陶洁 ² ; 李本强 ² ; 马玉飞 ² ; 程靖华 ² ; 张春玲 ² ; 刘惠莉 ³ ;

作者机构： 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海种猪工程技术研究中心;上海海洋大学水产与生命学院

2.;上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海种猪工程技术研究中心;上海海洋大学水产与生命学院

3.;上海市农业科学院畜牧兽医研究所上海种猪工程技术研究中心;上海海洋大学水产与生命学院;

关键词： 多重RT-PCR;猪嵴病毒;全基因组序列;遗传进化分析

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2017 年 08 期

页码： 1292-1303

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解引起猪腹泻疫病的病毒性病原种类及感染现状,本研究首先针对7种报道较少但可引起猪腹泻的病毒性病原建立了多重RT-PCR检测方法,包括猪捷申病毒(PTV)、猪萨佩罗病毒(PSV)、猪丁型冠状病毒(PDCo V)、猪嵴病毒(PKV)、猪札幌病毒(PSa V)、猪星状病毒(PAst V)和猪环曲病毒(PTo V)。利用该方法对419份临床腹泻粪便样品进行筛检,结果显示PKV检出率最高,阳性率达26.98%–45.79%;PKV和其他病原混合感染率达9.52%–18.54%。基于PKV的高检出率及其可能在猪腹泻疾病中发挥的作用,本试验进一步选取3个PKV阳性样品进行全基因组序列测定及遗传进化分析。结果表明,这3个阳性样品PKV均归属于猪嵴病毒属,且与其他动物嵴病毒遗传距离较远,分别标记为CM-PKV、JS-PKV和PD-PKV;它们的全基因组同源性为88.1%–89.1%;CM-PKV与2013年报道的中国株JS-02a-CHN/2013同源性最高,而JS-PKV和PD-PKV则与2008年报道的匈牙利株K-30-HUN/2008/HUN同源性最高。表明上海不同地区猪群中存在的PKV有明显的遗传差异,但毒株遗传特性的差异与其致病力的相关性需进一步研究。本研究为深入了解PKV的流行现状及探讨其在猪腹泻疫情中的作用提供了参考。