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甘蓝β-淀粉酶基因家族的鉴定及其响应低温胁迫的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 山溪 1 ; 陶美奇 1 ; 潘永飞 1 ; 秦文斌 1 ; 张振超 1 ; 姚悦梅 1 ; 戴忠良 1 ;

作者机构: 1.江苏丘陵地区镇江农业科学研究所

关键词: 甘蓝;BAM基因家族;低温胁迫;亚细胞定位

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2025 年 41 卷 002 期

页码: 345-354

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: β-淀粉酶(BAM)是植物水解淀粉的重要酶类,在植物应对非生物胁迫响应中有重要作用.本研究基于甘蓝BRAD参考基因组的全基因组序列,分离鉴定得到 20 个BolBAM基因,并对其家族成员进行系统发育分析、蛋白质特征分析、基因结构分析、不同器官/组织中的相对表达量分析、低温(2℃)胁迫下的基因表达模式分析.结果表明,从甘蓝中共鉴定得到 20 个BolBAM蛋白,BolBAM蛋白的氨基酸序列长度范围是 193 aa(BolBAM3c)~678 aa(BolBAM7);甘蓝BAM蛋白家族成员兼有弱酸性、弱碱性蛋白质;除BolBAM11、BolBAM12、BolBAM14 外,其他BolBAM蛋白均为亲水性蛋白质.RNA-Seq(转录组)分析结果表明,BolBAM1b、BolBAM5a、BolBAM9b在 7 个组织/器官中的相对表达量均较高,在花中BolBAM1b的相对表达量最高,在角果中BolBAM5a的相对表达量最高,在愈伤组织中BolBAM9b的相对表达量最高.本研究还发现,在甘蓝耐冷材料 923、冷敏材料D9 中,14 个BolBAM基因受到低温诱导表达;冷敏材料D9 中BolBAM3a的相对表达量在低温处理6h时高于耐冷材料923,但在低温处理24h时,其相对表达量显著低于 923;耐冷材料 923 中BolBAM3b的相对表达量在低温处理 6 h、24 h时均显著高于冷敏材料D9.本研究结果为后续开展BolBAM3a、BolBAM3b基因调控甘蓝应对低温胁迫的研究提供了重要参考.

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