您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

鲟形目鱼类rDNA扩增及限制性位点分析

文献类型: 中文期刊

作者: 汪登强 1 ; 危起伟 1 ; 罗晓松 1 ; 方耀林 1 ;

作者机构: 1.农业部淡水鱼类种质资源与生物技术重点开放实验室中国水产科学研究院长江水产研究所

关键词: 鲟形目;rDNA;PCR;限制性位点

期刊名称: 中国水产科学

ISSN: 1005-8737

年卷期: 2006 年 13 卷 06 期

页码: 885-890

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 使用长PCR技术扩增鲟形目(Acipenseriformes)15个种的核糖体DNA(rDNA)18S rRNA基因与28S rRNA基因之间约2.5 kb的片段,并用7个限制性内切酶对该片段进行限制性位点分析。结果显示,使用LATaqDNA聚合酶及GCBuffer结合长PCR技术能够很好地扩增鲟形目鱼类的rDNA。根据酶切图谱可确定93个限制性位点,其中21个为保守位点,72个多态信息位点。HhaⅠ酶切的带型在所有个体中完全一致,提示这些位点对保持rDNA的功能有重要作用。一些酶的酶切产物长度之和大于扩增产物的长度,暗示鲟形目鱼类个体内存在多个rDNA等位基因。对种间遗传距离进行计算,并构建UPGMA分子系统树,发现鲟科鱼类的系统关系与以往研究有较大差别,这可能是受个体内rDNA等位基因存在的影响,说明用酶切片段来重建鲟科鱼类的系统树不太可靠。文中还讨论了高GC含量模板的PCR扩增和rDNA在鲟形目分子系统关系中的使用。

  • 相关文献

[1]12种鲟形目鱼类mtDNA ND4L-ND4基因的序列变异及其分子系统学. 张四明,张亚平,郑向忠,陈永久,邓怀,汪登强,危起伟,张云武,聂龙,吴清江. 1999

[2]几种鲟鱼基因组大小、倍体的特性及鲟形目细胞进化的探讨. 张四明,晏勇,邓怀,汪登强,危起伟,吴清江. 1999

[3]鲟形目线粒体16S rRNA的部分序列变异及系统发生. 王荻,李绍戊,曲秋芝,孙大江,卢彤岩. 2010

[4]北美鲟形目主要种类生物学. 罗相忠. 1999

[5]13种鲟形目鱼类线粒体DNA的PCR-RFLP分析. 汪登强,危起伟,王朝明,罗晓松. 2005

[6]7种鲟形目鱼类亲缘关系的随机扩增多态性DNA研究. 张四明,邓怀,汪登强,吴清江. 1999

[7]日本沼虾ITS1序列分析及SNPs位点的筛选. 张洪伟,傅洪拓,吴滟,龚永生,王庆,夏德全. 2010

[8]Sensitive and rapid detection of Vibrio corallilyticus by loop-mediated isothermal amplification targeted to the alpha subunit gene of RNA polymerase. Liu, G. F.,Zhou, S. N.,Liu, G. F.,Wang, J. Y.,Xu, L. W.,Ding, X..

[9]Genetic Algorithm Applied to the Selection of Factors in Principal Component: ASQR study of Aromatic Hydrocarbons Toxicity to Chlorella vulgaris. Yang Sheng-Long,Wang Cui-Hua,Wu Yang,Yu Hong-Xia,Wang Lian-Shen. 2013

[10]Identification of differentially expressed genes in Tetrahmena thermophila in response to dichlorodiphenyltrichloroethane (DDT) by suppression subtractive hybridization. Miao, W,Yu, T,Orias, E,Wan, ML,Fu, CJ.

[11]Development of a rapid cyprinid herpesvirus 2 detection method by loop-mediated isothermal amplification. Liang, L. -G.,Xie, J.,Luo, D.,Luo, D..

[12]The first report of an iridovirus-like agent infection in fanned turbot, Scophthalmus maximus, in China. Shi, CY,Wang, YG,Yang, SL,Huang, J,Wang, QY.

[13]Molecular identification of genus Scylla (Decapoda: Portunidae) based on DNA barcoding and polymerase chain reaction. Ma, Hongyu,Ma, Chunyan,Ma, Lingbo.

[14]养殖刺参“腐皮综合征”致病菌——灿烂弧菌的原位杂交检测方法的建立与应用. 王印庚,荣小军,张凤萍,王岚,廖梅杰,邹安革. 2013

[15]应用PCR方法检测刺参腐皮综合征病原——灿烂弧菌. 张凤萍,王印庚,李胜忠,荣小军,廖梅杰,张正. 2008

[16]采用OIE标准检测养殖对虾中传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)的PCR检出类型. 袁颜颜,杨冰,万晓媛,刘笋,刘天齐,黄倢. 2015

[17]特异性靶基因在弧菌PCR快速检测中的应用. 邵蓬,汪笑宇,徐晓丽. 2015

[18]2013年中国典型对虾养殖区白斑综合征病毒流行株高变异区序列的分析比较. 孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢. 2016

[19]PCR技术在肉类掺假检验中的应用进展. 刘帅帅,李宏,罗世芝,刘云国. 2011

[20]肝胰腺细小病毒(HPV)PCR检测及流行情况调查. 刘天齐,杨冰,刘笋,万晓媛,王秀华,黄倢. 2014

作者其他论文 更多>>