文献类型： 中文期刊
作者： 李文云 1 ; 罗怿 1 ; 王小柯 1 ; 柏自琴 1 ; 林乾 1 ; 李金强 1 ;
作者机构： 1.贵州省果树科学研究所
关键词： 柑橘;牛肉红朱橘;抗氧化;差异表达基因;类胡萝卜素;苯丙烷
期刊名称： 贵州农业科学
ISSN： 1001-3601
年卷期： 2022 年 50 卷 002 期
页码： 63-69
收录情况： 北大核心
摘要： [目的]探明贵州地方特色柑橘种质牛肉红朱橘(NRH)抗氧化生物合成关键基因及表达特征,揭示其抗氧化生物活性的形成机理,为地方柑橘资源的开发利用提供依据.[方法]利用RNA-Seq技术对NRH及其亲本朱红橘(ZHJ)进行转录组测序分析.[结果]除去低质量数据后Clean reads数为(3.93~4.49)×107个,总净核苷酸数为(5.89~6.73)×109个;在阈值为| log2 (FoldChange)|>0和padj<0.05时,共筛选到1282个差异表达基因,其中上调833个,下调449个.GO功能富集分析共富集到9个差异类别.KEGG功能富集分析的代谢通路主要包括核糖体、淀粉和蔗糖代谢、类胡萝]素生物合成、MAPK信号通路和苯丙烷生物合成等.[结论]鉴定出2条与抗氧化密切相关的代谢通路,即类胡萝卜素(7个差异基因)和苯丙烷生物合成途径(16个差异基因),其中17个基因在NRH中上调表达,6个下调表达.
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