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五指山猪肌肉和脂肪组织miRNA的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 晁哲 1 ; 吴望军 1 ; 王林杰 1 ; 孙瑞萍 1 ; 刘海隆 1 ; 王峰 1 ;

作者机构： 1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所;南京农业大学动物科技学院;四川农业大学动物科技学院

关键词： 五指山猪;肌肉组织;脂肪组织;miRNA;靶基因

期刊名称： 畜牧与兽医

ISSN： 0529-5130

年卷期： 2020 年 009 期

页码： 7-12

收录情况： 北大核心

摘要： 为了鉴定和分析五指山猪不同部位肌肉和脂肪组织中差异表达的微小RNA (miRNA),采用高通量测序和生物信息学方法对五指山猪肌肉和脂肪组织中的miRNA进行分析筛选,运用DESeq分别鉴定背最长肌和半腱肌、背部和腹部皮下脂肪组织间差异表达的miRNA,并对miRNA进行靶基因预测分析.结果:在五指山猪肌肉组织中共鉴定出344个miRNA,其中已知miRNA 256个、新预测miRNA 88个,肌肉组织中预测到靶基因9 712个;在五指山猪皮下脂肪组织中共鉴定出447个miRNA,其中已知miRNA 279个、新预测miRNA 168个,脂肪组织中预测到靶基因11 510个;五指山猪背最长肌与半腱肌间存在41个差异表达的miRNA,腹部皮下脂肪与背部皮下脂肪间存在83个差异表达的miRNA.本试验为进一步研究miRNA调控猪骨骼肌和皮下脂肪发育的分子机制提供科学依据.

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