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葡萄中一类AP2/EREBP-B1亚族转录因子的电子克隆及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郑建立 1 ; 高峰 2 ; 田永生 2 ; 高建杰 2 ; 帅建军 2 ; 彭日荷 2 ; 熊爱生 2 ; 姚泉洪 2 ;

作者机构: 1.南京农业大学园艺学院

2.南京农业大学园艺学院;上海市农业科学院生物技术研究所;扬州大学生物科学与技术学院

关键词: 葡萄;AP2/EREBP;电子克隆;转录因子;生物信息学

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2011 年 27 卷 03 期

页码: 15-21

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用电子克隆(In silico cloning)的方法获得3个葡萄ERF类转录因子VvERF2.1、VvERF2.2、VvERF2.3,利用生物信息学方法对基因推导的氨基酸序列从氨基酸组成、理化性质、进化关系、高级结构和功能等方面进行了预测和分析。结果表明:3个转录因子属于AP2/EREBP-B1亚族,与其他物种的ERF在序列组成、结构及活性位点等方面具有高度的一致性。

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