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猪巨细胞病毒福建株DPOL基因的克隆及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈如敬 1 ; 陈铖 2 ; 吴学敏 1 ; 车勇良 1 ; 严山 1 ; 王晨燕 1 ; 王隆柏 1 ; 周伦江 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

2.福安市动物疾病预防控制中心

关键词: 猪巨细胞病毒;DPOL基因;克隆;序列分析;病毒分类

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2017 年 44 卷 02 期

页码: 365-370

收录情况: 北大核心

摘要: 为了明确猪巨细胞病毒(porcine cytomegalovirus,PCMV)福建株(PCMV-FJ01株)DPOL基因特征,本研究根据GenBank数据库中PCMV DPOL基因序列特征,利用引物设计软件Oligo 7.0设计针对DPOL基因的引物,以PCMV-FJ01株核酸DNA为模板,对其进行分段PCR扩增。将分段扩增的产物经胶回收试剂盒回收后进行克隆测序,对测序结果进行拼接后获得PCMV-FJ01株DPOL基因序列,并进行生物信息学分析。结果表明,PCMV-FJ01株DPOL基因全长为3 021bp,编码1 006个氨基酸;其与GenBank中的PCMV分离株DPOL基因核苷酸和氨基酸同源性分别在98.7%和99.1%以上。遗传进化分析发现,相对于巨细胞病毒属其他种代表株,PCMV分离株DPOL基因在遗传进化上和玫瑰疱病毒属代表株更近。建议根据PCMV DPOL基因遗传进化特征,将其划归为玫瑰疱病毒属的一个病毒新种——猪玫瑰疹病毒(porcine roseolovirus)。

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