您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

鲟形目线粒体16S rRNA的部分序列变异及系统发生

文献类型: 中文期刊

作者: 王荻 1 ; 李绍戊 1 ; 曲秋芝 1 ; 孙大江 1 ; 卢彤岩 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: 鲟形目;线粒体DNA;16S rRNA;系统树

期刊名称: 吉首大学学报(自然科学版)

ISSN: 1007-2985

年卷期: 2010 年 06 期

页码: 85-90

摘要: 采用通用引物对3种鲟形目(Acipenseriformes)鱼类,中华鲟(Acipenser sinensis)、俄罗斯鲟(Acipenser gueldenstaedtii)和匙吻鲟(Polyodon spathula)的16S rRNA基因部分片段进行扩增,并与NCBI数据库中获得另外6种鲟形目鱼类相应的16S rRNA序列部分进行比较,探讨鲟形目2个科5个属共9个种之间的遗传变异和亲缘关系.数据合并后用于分析的序列共514 bp,变异位点29个,含简约信息位点16个,单一信息位点13个.以多鳍鱼目(Polypteriformes)多鳍鱼属Polypterus ornatipinnis为外群,采用部分16S rRNA序列基于Kimura双参数模型构建其系统发育关系,结果表明:MP法和NJ法得到系统树基本相同,其科、亚科和属的分化上基本与传统形态学分类相吻合,另外,欧鳇与鲟属鱼类的分化也并不明显.值得注意的是,鲟亚科6个种所划分出的3个分支恰恰分别归属于3个地理区域,欧鳇、闪光鲟和俄罗斯鲟主要集中于黑海和里海流域等地区;中华鲟和达氏鲟分布在西北太平洋,中国长江流域以及朝鲜;而高首鲟则分布于东太平洋.

  • 相关文献

[1]13种鲟形目鱼类线粒体DNA的PCR-RFLP分析. 汪登强,危起伟,王朝明,罗晓松. 2005

[2]中国近海11种鳀科鱼类分子系统发育的初步研究. 马春艳,沈盎绿,马凌波,倪勇,张永. 2010

[3]东海常见鲳属鱼类的形态差异及系统进化关系探讨. 赵峰,马春艳,庄平,章龙珍,施兆鸿. 2011

[4]3种野鲮亚科鱼类16S rRNA基因序列分析. 江世贵,张殿昌,吕俊霖,李建柱. 2005

[5]12种鲟形目鱼类mtDNA ND4L-ND4基因的序列变异及其分子系统学. 张四明,张亚平,郑向忠,陈永久,邓怀,汪登强,危起伟,张云武,聂龙,吴清江. 1999

[6]几种鲟鱼基因组大小、倍体的特性及鲟形目细胞进化的探讨. 张四明,晏勇,邓怀,汪登强,危起伟,吴清江. 1999

[7]鲟形目鱼类rDNA扩增及限制性位点分析. 汪登强,危起伟,罗晓松,方耀林. 2006

[8]北美鲟形目主要种类生物学. 罗相忠. 1999

[9]7种鲟形目鱼类亲缘关系的随机扩增多态性DNA研究. 张四明,邓怀,汪登强,吴清江. 1999

[10]我国东南沿海厚壳贻贝(Mytilus coruscus)4个群体线粒体16S rRNA序列及遗传结构分析. 叶莹莹,徐梅英,郭宝英,吴常文. 2012

[11]舌鳎亚科鱼类单系起源和同种异名的线粒体DNA证据. 柳淑芳,刘进贤,庄志猛,高天翔,韩志强,陈大刚. 2010

[12]虹鳟肠炎红嘴病病原菌的确定及其生长特性研究. 连浩淼,卢彤岩,刘红柏,尹家胜,张辉,李绍戊. 2015

[13]基于454和Illumina高通量测序平台对长江口邻近海域沉积物微生物群落的比较分析. 王勋功,李迎,甄毓,米铁柱,贺惠,张玉. 2018

[14]云斑尖塘鳢烂身病病原分离鉴定及药敏试验. 麦耀宝,陈智光,陈灼均,李本旺,林强. 2018

[15]瓶鼻海豚、中华白海豚和糙齿海豚线粒体16S rRNA基因的序列分析. 李莉好,郭奕惠,黄桂菊,江世贵,贾晓平,喻达辉. 2007

[16]中国南海野生斑节对虾5个地理群体线粒体16S rRNA基因序列比较分析. 周发林,江世贵,姜永杰,黄建华,马之明. 2009

[17]一株好氧反硝化细菌的分离鉴定及反硝化能力初测. 战海,王广军,陈成勋. 2017

[18]鲢病原嗜水气单胞菌分离鉴定及检测方法的建立. 梁利国,谢骏,叶诗尧. 2013

[19]基于线粒体16S rRNA和COI序列的江苏启东海域4种贝类遗传多样性分析. 闫永斌,葛玉双,程起群,范瑞良,李楠楠,全为民. 2022

[20]海南三亚斑节对虾野生种群mtDNA 16S rRNA基因和控制区序列的多态性. 周发林,江世贵,姜永杰,黄建华,马之明. 2006

作者其他论文 更多>>