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传统发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组特征与糖代谢表型分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴青海 1 ; 三月 2 ; 萨初拉 1 ; 郭煜 1 ; 王力伟 1 ; 王莉梅 1 ; 杨静 1 ; 其布日 1 ;

作者机构: 1.内蒙古自治区农牧业科学院生物技术研究所

2.内蒙古商贸职业学院餐饮食品系

关键词: 传统发酵乳;短乳杆菌HQ1-1;全基因组测序;功能基因;糖代谢表型

期刊名称: 食品与发酵科技

ISSN: 1674-506X

年卷期: 2024 年 60 卷 006 期

页码: 1-7,21

摘要: 该文探究传统发酵乳源短乳杆菌(Lactobacillus brevis)HQ1-1的基因组基本特征和糖代谢表型。经PacBio平台对短乳杆菌HQ1-1进行全基因组测序,并对基因组进行功能分类和注释。结果显示,短乳杆菌HQ1-1包含1条长度为2 376 708 bp的环状染色体和7个大小不同的质粒DNA,编码2 268个基因。通过KEGG数据库注释到参与代谢过程的基因有860个,其中,碳水化合物代谢相关基因的数量为142个,占比为16.51%。进一步用CAZy数据库注释到了糖苷水解酶类基因114个,占碳水化合物相关基因总数的45.24%。通过OmniLog微阵列表型芯片分析发现,短乳杆菌HQ1-1对L-阿拉伯糖、D-木糖、D-核糖、L-来苏糖等碳源的利用效率相对更高。因此,发酵乳源短乳杆菌HQ1-1基因组中包含碳水化合物代谢相关基因的数量较多,能够利用多种碳源。该文全面阐述了短乳杆菌HQ1-1基因组特征和代谢表型,为今后开发功能性发酵食品提供新型乳酸菌发酵剂。

  • 相关文献

[1]基于CiteSpace的肉牛肠道菌群功能基因的文献计量学分析. 杨鼎,伊风艳,吴江鸿,王潇,赵濛,刘欣超,田如刚. 2023

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