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百脉根Hsp70s基因家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨芳 1 ; 杨仕梅 1 ; 罗雪 1 ; 吴佳海 2 ; 宋莉 1 ;

作者机构： 1.贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院山地农业资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室

2.贵州省农业科学院

关键词： 百脉根;LiHsp70s基因结构;热激蛋白;生物信息学;功能预测

期刊名称： 山地农业生物学报

ISSN： 1008-0457

年卷期： 2020 年 39 卷 005 期

页码： 1-8

摘要： 热激蛋白(HSPs)是细胞受逆境诱导产生的一类具有稳定蛋白质结构、修复变性蛋白和维护生物膜稳定等功能的分子伴侣,同时,在缓解植物高温伤害和提高热耐受性等方面有重要的调控作用.根据百脉根基因组数据,利用生物信息学方法对百脉根Hsp70基因(LjHsp70s)家族的基因结构、染色体分布、选择压力、顺式作用元件、表达特性和系统进化等进行分析.结果表明,LjHsp70s家族有18个成员,分为4类,它们的内含子和外显子数量为1~8,含有多个保守基序,分布在6条染色体上,编码602~703个氨基酸,均编码酸性亲水蛋白;含有激素、光照及胁迫等响应顺式作用元件,LjHsp70s在百脉根的根、茎、叶等部位均有表达,但其表达量不同;该家族基因在进化过程中主要受负选择作用,进化上较为保守,家族成员与拟南芥和烟草的Hsp70基因可分为6组,但是百脉根LjHsp70s基因仅存在于4个亚族中,表明其与拟南芥、烟草的Hsp70s基因家族成员之间进化关系密切,同时也存在一定差异.LjHsp70s基因在百脉根的各个部位均有表达,对百脉根生长发育过程起着重要的作用,研究结果为解析百脉根LjHsp70s基因功能提供了依据.

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