文献类型： 中文期刊

作者： 殷剑美 ¹ ; 王立 ¹ ; 蒋璐 ¹ ; 韩晓勇 ¹ ; 郭文琦 ¹ ; 李春宏 ¹ ; 张培通 ¹ ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院经济作物研究所江苏省农业生物学重点实验室

关键词： 芋;流式细胞术;基因组测序;基因功能注释;倍型水平;基因组特征

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2019 年 06 期

页码： 1284-1291

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用流式细胞术,对2个芋[Colocasiaesculenta(L.) Schott]品种苏芋1号和香蕉芋的倍性水平和DNA含量进行了测定,2倍基因组DNA含量分别为7.71 pg和5.25 pg,倍性分别为三倍体和二倍体。同时通过HiSeq 2500测序,分别获得240.53 Gb和87.69 Gb数据,芋基因组大小为2.08～2.38 Gb,GC含量为42.57%～42.75%,杂合度为0.52%～2.29%。根据苏芋1号的基因组数据,组装得到基因组序列为2.27 Gb,Contig N50为359 bp;共注释获得24 302个基因,99.43%的基因可注释到6个公共数据库;筛选出928 987个SSR位点。