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高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李植良 1 ; 罗少波 1 ; 陈日远 2 ; 金庆敏 1 ; 黎振兴 1 ; 李德明 3 ; 孙保娟 1 ; 孙光闻 2 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院蔬菜研究所

2.华南农业大学园艺学院

3.海南省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 茄子;高温胁迫;内参基因;表达稳定性;实时荧光定量PCR

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2017 年 44 卷 03 期

页码: 475-486

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为筛选茄子(Solanum melongena L.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40s RPS29、Sm60s RPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、Norm Finder、Best Keeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性。结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和SmTRX;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好。综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCK I的表达稳定性较差。

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