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猪流行性腹泻病毒ORF3和M基因的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王隆柏 1 ; 吴学敏 1 ; 车勇良 1 ; 陈如敬 1 ; 魏宏 1 ; 刘玉涛 1 ; 庄向生 1 ; 周伦江 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心

关键词: 猪流行性腹泻病毒;ORF3基因;M基因;序列分析

期刊名称: 中国动物传染病学报

ISSN: 1674-6422

年卷期: 2012 年 20 卷 03 期

页码: 67-72

摘要: 为了解福建省猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3和M基因变异情况,本研究从4个不同规模猪场发生仔猪"顽固性腹泻"疾病的病料中扩增到4株PEDV的ORF3和M基因,并进行了序列分析。结果表明:4株PEDV ORF3基因均含有675个碱基,编码224个氨基酸,与GenBank中登录的代表性PEDV核苷酸的同源性为89.7%~100.0%,氨基酸的同源性为94.7%~99.6%,其中FJPT毒株核苷酸的同源性与CV777 truncated毒株最低,仅为89.7%,FJNP毒株核苷酸的同源性与中国北方流行的CH ZKFG 11毒株最高,达100.0%。M基因含有681个碱基,编码226个氨基酸,与GenBank中登录的代表性PEDV核苷酸的同源性为94.8%~100.0%,氨基酸的同源性为94.8%~99.6%,其中FJPT毒株核苷酸的同源性与日本D89752毒株最低,仅为94.8%,FJNP毒株核苷酸的同源性与韩国CPF193、泰国毒株最高,达100.0%。4株PEDV毒株均与国内外流行强毒株的亲缘关系较近,与attenuate DR13弱毒株的亲缘关系较远。

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