您好,欢迎访问上海市农业科学院 机构知识库!

基于转录组挖掘香菇木质纤维素降解相关基因

文献类型: 中文期刊

作者: 刘慧杰 1 ; 游潇轩 1 ; 戈永杰 1 ; 尚晓冬 2 ; 谭琦 2 ;

作者机构: 1.上海海洋大学食品学院

2.上海市农业科学院食用菌研究所

关键词: 香菇;转录组分析;木质纤维素;基质利用

期刊名称: 食用菌学报

ISSN: 1005-9873

年卷期: 2024 年 004 期

页码: 33-45

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对用木屑培养料(木屑组)和PDA培养基(PDA组)培养的香菇(Lentinula edodes)菌丝进行转录组测序分析,对两组样本进行主成分分析和相关性分析,对差异表达基因进行筛选和聚类分析;以PDA组为对照,对木屑组中显著差异表达的基因进行筛选以及GO功能富集、KEGG代谢通路分析;采用定量PCR方法验证9个差异表达基因表达情况。结果表明:培养基质造成的基因表达差异大于菌株,8个样本可分为两组(PDA组和木屑组);与PDA组相比,木屑组有677个基因的表达存在显著差异,其中445个基因(与木质纤维素降解相关的180个)上调,232个基因(与木质纤维素降解相关的38个)下调,表明木屑培养基能够显著诱导木质纤维素降解相关基因表达。GO功能富集分析结果表明,上调表达基因在氧化还原酶活性、水解酶活性、代谢过程、水解酶活性(水解O-糖基化合物)、水解酶活性(作用于糖基键)等代谢过程中显著富集。KEGG代谢通路分析结果表明,上调表达基因在溶酶体、转运蛋白、氨基糖和核苷酸糖代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、淀粉和蔗糖代谢、肽酶和抑制剂通路中显著富集;下调表达基因在MAPK信号通路-酵母、不饱和脂肪酸生物合成、二噁英降解通路中显著富集。研究结果为揭示香菇培养基质利用的分子机制和选育高效利用基质菌株提供参考。

  • 相关文献

[1]木屑培养基中辅料的种类和含量对香菇生长发育的影响. 倪新江,潘迎捷,冯志勇,李人圭. 1995

[2]香菇生长过程中木质纤维素的生物降解规律. 潘迎捷,倪新江,李人圭. 1995

[3]废菌糠及其辅料对香菇培养料中木质纤维素降解的影响. 冯志勇,汪昭月,潘迎捷,陈明杰. 1996

[4]五株工厂化栽培的黑木耳生理特性比较. 陈辉,郝海波,赵静,顾忆龙,汪虹,王倩,陈明杰,张津京. 2020

[5]食用菌栽培基质中木质纤维素组分测定方法的建立. 王倩,宋晓霞,周帅,钱武兵,黄慢慢,肖婷婷,陈明杰,黄建春. 2019

[6]曲酸对斑玉蕈子实体形成过程中木质纤维素酶的影响研究. 张津京,汪虹,陈明杰,王倩,宋晓霞,隽加香,冯志勇,叶明,陈辉. 2018

[7]木质纤维素对青年后备蛋鸡胃肠发育和肠道功能的影响. 朱丽慧,吕文纬,孔德富,杨长锁. 2021

[8]白腐真菌对稻草秸秆的降解及其有关酶活性的变化. 杭怡琼,薛惠琴,郁怀丹,陈谊. 2001

[9]利用白腐真菌对稻草秸秆的降解研究. 杭怡琼,薛惠琴,陈谊,张似青,刘兆良. 2002

[10]利用转录组分析茉莉酸甲酯对金针菇原基生长的影响. 李玉,朱秋瑾,李巧珍,陆欢,王瑞娟,杨慧,尚晓冬,刘建雨. 2022

[11]茄子耐低温性差异材料的筛选及其转录组分析. 朱宗文,吴雪霞,张爱冬,查丁石. 2021

[12]基于转录组测序的枇杷腋芽成花相关基因的筛选. 章加应,肖海涛,张学英,安海山,徐芳杰,周博强. 2022

[13]低温胁迫影响大麦小孢子全能性机制解析. 李文瑞,李颖波,郭桂梅,宗营杰,周龙华,徐红卫,刘成洪. 2024

[14]番茄含糖量不同的两个材料果实转录组初步分析. 张文昊,张辉,刘雨婷,王艳,张迎迎,王馨曼,王全华,朱为民,杨学东. 2024

[15]香菇高密度SNP遗传连锁图构建. 林范学,李宏盛,鲍大鹏,黄丹枫. 2012

[16]交配型对香菇单、双核菌丝体菌丝生长速度的影响. 鲍大鹏,李宏盛,冯磊,梁保东,林范学. 2012

[17]香菇135菌株特异SCAR标记的分布和遗传特性. 张美彦,尚晓冬,谭琦,陈明杰. 2009

[18]香菇生产用菌株的SCAR鉴定. 宋春艳,上海市农业科学院食用菌研究所,谭琦,陈明杰,潘迎捷. 2005

[19]稻麦秸屑栽培香菇技术研究. 杨瑞长,宋士良,蒋逵良,周琳. 1998

[20]不同培养基上香菇菌丝体酯酶同工酶的差异性研究. 贺冬梅,陈明杰. 1998

作者其他论文 更多>>