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猪繁殖与呼吸综合征病毒Shanxi-6株全基因序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 韩一超 1 ; 刘文俊 1 ; 姚敬明 1 ; 吴忻 1 ; 王娟萍 1 ; 武守艳 1 ; 陈剑波 1 ; 孟帆 1 ; 郭慧慧 1 ; 杨丽华 1 ; 雷宇平 2 ; 樊振华 1 ;

作者机构: 1.山西省农业科学院

2.山西省动物疫病预防控制中心

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒;基因组;序列分析

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2014 年 29 卷 02 期

页码: 65-68

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用RT-PCR方法,分段扩增出猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)Shanxi-6株15个基因片段,并将这15个片段分别连接到pMD18-T载体上进行克隆测序、拼接后,得到PRRSV Shanxi-6株全基因组长15 320 bp(不包含PolyA尾),包含9个开放阅读框,5'UTR长189 bp,3'UTR长150 bp。基因组序列分析结果表明,Shanxi-6株与欧洲型代表毒株LV的核苷酸序列同源性为54.35%,与美洲型代表毒株VR-2332的核苷酸序列同源性为88.80%,与HPPRRSV毒株(JXA1、HUN4、HuN、HUB1)亲缘关系最近,核苷酸序列同源性高达97.44%~97.74%,且在非结构蛋白Nsp2上有30个氨基酸的缺失。

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