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新发猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传进化分析

文献类型: 中文期刊

作者: 董世娟 1 ; 朱于敏 1 ; 于瑞嵩 1 ; 司伏生 1 ; 石明明 1 ; 张源淑 2 ; 李震 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所

2.南京农业大学动物医学院

关键词: 猪流行性腹泻病毒;分子流行病学;ORF3基因;遗传变异

期刊名称: 华中农业大学学报

ISSN: 1000-2421

年卷期: 2014 年 05 期

页码: 91-98

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从浙江地区分离的2株代表性样品与全国范围内流行的参考毒株进行比对和遗传进化分析,结果分为4个组,代表性样品与大部分国内的毒株落入G4-2组,与国内早期CH-S毒株核苷酸(氨基酸)同源性为98.4%~98.5%(99.1%~99.6%);以华南地区为主的2011-2012年分离的毒株自成一组,与中国其他地区的毒株的同源性为95.0%~97.2%,与其余3组比较有9个核苷酸的变异。遗传进化分析表明所分离毒株与大部分中国的流行毒株属于一个基因型;以2011-2012年中国华南地区为主的毒株成为PEDV的一个新的基因型;提示2011-2012年中国流行着2种PEDV的基因型。

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