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生物信息学对扩展莫尼茨绦虫cDNA文库Cavβ基因分析与B细胞抗原表位预测

文献类型: 中文期刊

作者: 赵文娟 1 ; 康立超 1 ; 王正荣 1 ; 薄新文 1 ; 王新华 1 ;

作者机构: 1.新疆农垦科学院/新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室

关键词: 扩展莫尼茨绦虫;Cavβ;二级结构;B细胞抗原表位;功能预测

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2012 年 49 卷 04 期

页码: 735-742

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】分离和鉴定扩展莫尼茨绦虫(Moniezia expansa)电压门控钙通道β亚基(Cavβ)基因,预测蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨Cavβ在寄生虫病治疗中所起的作用。【方法】构建扩展莫尼茨绦虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行引物步移法测序,获取全长cDNA序列;采用生物信息学方法对其对应的蛋白进行二级结构和B细胞抗原表位的预测。【结果】获得扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因,全长946 bp,编码180个氨基酸,理论分子质量为19.788 8 kD,等电点为5.06,属于Cachannel B超家族。二级结构以无规则卷曲为主,结构预测存在4个可能的B细胞抗原表位。【结论】研究对于扩展莫尼茨绦虫Cavβ基因的获得和B细胞抗原表位的预测,为该基因功能的试验性鉴定工作奠定了基础。

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