文献类型： 中文期刊
作者： 吴莹莹 1 ; 孟宪红 2 ; 孔杰 2 ; 王清印 2 ; 栾生 2 ; 罗坤 2 ;
作者机构： 1.山东省海水养殖研究所
2.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室
关键词： 中国对虾;单核苷酸多态性;高分辨率熔解曲线
期刊名称： 渔业科学进展
ISSN： 1000-7075
年卷期： 2013 年 34 卷 01 期
页码： 111-118
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用高分辨率溶解曲线(High resolution melt,HRM),结合非标记探针技术,对中国对虾转录组EST测序序列中的118个候选SNP位点进行了位点多态性检测,获得了39个具有二等位基因多态性的SNP位点,占总候选位点的比例为33.1%。对这些SNP位点在一个48尾中国对虾群体中的多态性进行了分析,结果表明,观测杂合度Ho和期望杂合度He的分布范围分别为0.000～0.947和0.049～0.506,有效等位基因数分布范围为1.051～1.999,平均为1.574;多态信息含量分析显示39个位点的PIC值范围为0.0476～0.375,平均为0.272。另外,基因功能注释表明,39个多态SNP所在contig序列所对应的基因大都与免疫相关。以上这些结果表明,非标记探针HRM是一种简单快速而有效的SNP开发技术,可为中国对虾群体遗传学和遗传育种分析提供有效的候选标记。
- 相关文献
[1]刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析. 刘安然,廖梅杰,李彬,王印庚,荣小军,张正,范瑞用,陈贵平. 2019
[2]中国对虾“黄海2号”人工感染WSSV病毒的定量检测. 孟宪红,孔杰,罗坤,栾生,张天时,张庆文. 2009
[3]对虾工厂化养殖和土池养殖溶解氧消耗研究. Liu Haiying,刘海英,Qu Keming,曲克明,Li Jian. 2008
[4]渤海中国对虾、三疣梭子蟹、海蜇放流状况与效果. YANG Wen-bo,杨文波,LI Hui-qin. 2010
[5]诺氟沙星2种不同给药方式在中国对虾体内的残留及消除规律. 孙铭,李健,张喆,王静凤. 2010
[6]中国对虾不同发育阶段肝胰腺、卵巢及血淋巴中孕酮和雌二醇含量的变化. 蔡生力,杨丛海,赵维信,李德尚. 2000
[7]从野生到家养——中国对虾养殖发展述评. 王清印. 2014
[8]渤海中国对虾资源增殖调查. 李忠义,王俊,赵振良,周军,吕振波,董婧,刘茂利,金显仕. 2012
[9]不同饵料组合对中国对虾幼体WSSV携带量及存活率的影响. 肖广侠,孟宪红,孔杰,曹宝祥,刘宁,张庆文,罗坤,李战军. 2013
[10]中国对虾不同凝集素基因应答WSSV侵染的表达差异. 高焕,赖晓芳,王伟继,孟宪红,孔杰. 2012
[11]中国对虾Rab7全长cDNA的克隆及原核表达. 卢金凤,梁高峰,梁艳,黄倢. 2012
[12]5-溴尿嘧啶处理受精卵对中国对虾抗病和生长的影响. 张天时,赖光艳,孔杰,王清印,罗坤,黄雪芹. 2010
[13]中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)“黄海3号”新品种的培育. 李健,何玉英,王清印,刘萍,李吉涛,王学忠. 2015
[14]中国对虾抗病性状遗传标记筛选及遗传多样性分析. 李素红,张天时,孔杰,孟宪红. 2009
[15]微卫星技术对黄、渤海海域7个不同地理群体中国对虾的遗传结构和遗传分化研究. 孟宪红,孔杰,王清印,刘萍. 2008
[16]磺胺类药物在中国对虾3种组织中的代谢情况. 李金宝,李健. 2014
[17]中国对虾人工选育快速生长群体不同世代间的AFLP分析. 李朝霞,李健,何玉英,刘萍,王清印. 2006
[18]天津海域中国对虾资源量分析. 谷德贤,王婷,刘国山,刘茂利,王晓宇. 2014
[19]悬浮物对中国明对虾幼体急性毒性效应研究. 张艳,郑琳,谢寒冰,陈碧鹃,夏斌,周明莹. 2017
[20]三种常见经济虾蟹类眼柄微结构分析. 蒋瑞,刘必林,刘华雪,冯春雷,张健,倪震宇,吴旭干,张虎,舒畅,鲁玉渭. 2018
作者其他论文 更多>>
-
基于深度学习算法的凡纳滨对虾生长表型测定系统研发及应用
作者：张士薇;代平;高广春;孟宪红;罗坤;隋娟;谭建;傅强;曹家旺;陈宝龙;李旭鹏;强光峰;邢群;戚云辉;孔杰;栾生
关键词：凡纳滨对虾;生长表型;深度学习;计算机视觉;测定系统
-
零鱼粉饲料与高鱼粉饲料饲喂下凡纳对虾饲料利用效率相关性状的遗传评估
作者：朱相燕;孟宪红;代平;孔杰;栾生;曹家旺;谭建;邢群
关键词：凡纳对虾;饲料效率比;遗传力;遗传相关;基因型与饲料互作
-
凡纳对虾高低繁殖力群体卵巢组织学观察及相关候选基因的表达分析
作者：张建春;孔杰;曹家旺;谭建;代平;孟宪红;罗坤;傅强;陈宝龙;刘东亚;邢群;隋娟;栾生
关键词：凡纳对虾;繁殖;卵巢;组织学;基因;表达模式
-
凡纳滨对虾在低氧环境下存活性状的遗传参数评估
作者：段毓佳;谭建;栾生;罗坤;王宏杰;隋娟;孟宪红;孔杰
关键词：凡纳滨对虾;低溶解氧;遗传力;组织损伤;选育
-
凡纳滨对虾易位子相关蛋白α亚基(TRAPα)基因解析及其与WSSV抗性的关联
作者：王晶晶;李旭鹏;薛倩;曹宝祥;栾生;罗坤;隋娟;代平;曹家旺;谭建;陈宝龙;傅强;孔杰;高焕;孟宪红
关键词：凡纳滨对虾;白斑综合征病毒（WSSV）;TRAP;表达水平;SNP;DNA甲基化
-
利用"黄海芯1号"55K SNP芯片评估凡纳滨对虾选育群体的遗传多样性与基因组近交水平
作者：刘丹阳;孔杰;王平;陈荣坚;傅强;罗坤;陈宝龙;隋娟;孟宪红;代平;谭建;曹家旺;李旭鹏;康子仪;刘绵宇;强光峰;迟长凤;栾生
关键词：凡纳滨对虾;黄海芯1号;遗传多样性;连续性纯合片段;基因组近交系数
-
凡纳对虾核心育种群生长和抗WSSV性状的遗传参数估计
作者：和怡婧;李旭鹏;栾生;孔杰;曹宝祥;罗坤;谭建;曹家旺;陈宝龙;代平;邢群;刘绵宇;强光峰;刘杨;隋娟;孟宪红
关键词：凡纳对虾;遗传参数;生长;存活;WSSV
