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香蕉枯萎病致病菌尖孢镰刀菌4号生理小种micro-like RNA及其靶标基因的鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 李静宇 1 ; 许林兵 2 ; 应帆 1 ; 肖维强 2 ; 陈谷 1 ;

作者机构： 1.华南理工大学轻工与食品学院

2.广东省农业科学院果树研究所

关键词： 香蕉枯萎病菌4号生理小种;mil RNA;降解组测序

期刊名称： 现代食品科技

ISSN：

年卷期： 2021 年 002 期

页码： 56-63

收录情况： 北大核心

摘要： 香蕉枯萎病已严重威胁香蕉产业的发展,为了分析香蕉枯萎病菌尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种（Fusarium oxysporum F. sp. cubense race 4,Foc4）中mi RNA-like（mil RNA）及其调控功能,本研究构建了3个Foc4菌丝小RNA测序文库,测序得到原始数据11783990条,其中可用于后续mil RNA鉴定的有效数据3351578条,通过与mi Rbase中植物mi RNA和已报道的真菌mil RNA进行比对,共预测出7个保守的和3个新型的mil RNA。进而利用降解组测序预测mil RNA靶基因,共预测出53对mil RNA-m RNA。通过对靶基因进行GO和KEGG富集分析,发现mil RNA与多个代谢通路有关,包括嘌呤代谢,甘油磷脂代谢,硫胺素代谢和三羧酸循环通路等,对真菌生长发育有重要影响;同时发现mil RNA靶向ABC转运器CDR4和孢子壁成熟蛋白DIT1,可能对Foc4致病过程具有重要影响。本研究在高通量测序获得mil RNA的基础上,首次在香蕉枯萎病致病菌Foc4中利用降解组测序分析了mil RNA靶基因,对研究真菌mil RNA调控提供了重要参考,也为香蕉枯萎病的防治提供了新的思路。

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