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AMETH_3452基因在拟无枝酸菌中的系统发育分析

文献类型： 中文期刊

作者： 唐标 1 ; 吴静 1 ; 郑华军 2 ; 赵维 3 ; 杨华 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院农产品质量安全与营养研究所

2.上海人类基因组研究中心

3.中国科学院深圳先进技术研究院

关键词： AMETH3452;拟无枝酸菌;系统发育

期刊名称： 浙江农业科学

ISSN：

年卷期： 2021 年 004 期

页码： 763-767

摘要： AMETH3452基因是拟无枝酸菌（Amycolatopsis）中发现的一个放线菌的保守基因,位于拟无枝酸菌属中的环形基因组中间位置。为进一步探究该基因的序列特征并挖掘该基因的应用潜力,本研究将该基因构建在pET28载体上,在大肠杆菌中进行表达,使用蛋白预测网站进行了二级结构和保守区分析,对其直系同源基因在拟无枝酸菌属进行了系统发育分析。AMETH3452蛋白在大肠杆菌的上清液中可溶性表达。该基因在拟无枝酸菌属的核酸同源性为79.23%～99.02%,在300～500 bp的序列一致性较高。该蛋白序列共269个氨基酸,作为分子标记在76个拟无枝酸菌中进行系统发育分析后发现,东方拟无枝酸菌分支和甲基拟无枝酸菌分支稳定性高,同时可将东方拟无枝酸菌分支分成AORIS和AMEDS 2个可稳定的分支。以上研究将为AMETH3452基因作为检测环境、动物或临床上的放线菌或系统发育应用研究提供依据。

  • 相关文献

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[2]参与辣椒素合成的DnaJ基因家族全表达谱分析. Fang Fanfei,Liu Fawan,Yang Xian,Wan Hongjian,Kang Yunyan,刘周斌. 2020

[3]大黄鱼热激蛋白cDNA克隆及系统发育分析. 李明云,张祖兴,邬勇,陈炯,史雨红. 2007

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