文献类型： 中文期刊
作者： 常玉梅 1 ; 匡友谊 2 ; 梁利群 2 ; 鲁翠云 2 ; 何建国 2 ; 孙效文 2 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
2.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;中山大学生命科学学院
关键词： 鲤鱼;in silico;微卫星标记;Blast
期刊名称： 动物学研究
ISSN： 0254-5853
年卷期： 2008 年 29 卷 04 期
页码： 373-378
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 应用in silico的方法,利用Blastn和Blastx搜索引擎,将鲤鱼微卫星序列与GenBank数据库进行同源序列比对。利用Blastn,将侧翼序列长度>50bp的875个鲤鱼微卫星序列与斑马鱼的EST数据库首先进行比对,结果找到了121个同源序列。随后采用Blastx搜索蛋白质数据库,有94个微卫星位点存在同源蛋白。除了33个假定和3个未知蛋白外,剩余的58个微卫星位点被成功地进行了功能注释,而且其中的7个位点已经定位在了鲤鱼连锁图谱上。另外,通过PCR-SSCP的方法,将两个与鲤鱼微卫星侧翼序列相匹配的斑马鱼EST序列开发成鲤鱼的STS标记,并将其中的一个标记HLJZe33定位到鲤鱼连锁图谱上。以上研究结果表明,通过比较基因组研究,模式生物斑马鱼的很多遗传和基因组资源都可以被利用到鲤鱼的基因组研究中。
- 相关文献
[1]微卫星标记在鲤野生和养殖群体遗传多样性分析中的应用. 梁利群,孙效文. 2002
[2]Cloning and analysis of the full-length Rubisco large subunit (rbcL) cDNA from Ulva linza (Chlorophyceae, Chlorophyta). Ying, Cheng-Qi,Yin, Shun-Ji,Shen, Yi,He, Pei-Min,Ying, Cheng-Qi,Lin, Sen-Jie.
[3]Authentication and traceability of fish maw products from the market using DNA sequencing. Wen, Jing,Zeng, Ling,Sun, Yulin,Chen, Daohai,Xu, Youhou,Luo, Peng,Zhao, Zhe,Yu, Zonghe,Fan, Sigang.
[4]鲤鳞被SLC25A5基因的克隆和表达分析. 张保勇,蒋丽,程安达,王书,孙效文. 2012
[5]鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位. 常玉梅,高国强,徐丽华,刘金亮,刘春雷,梁利群. 2010
[6]鲤鱼(Cyprinus carpio L.)体重和体长QTL的定位. 刘继红,张研,常玉梅,梁利群,张晓峰,鲁翠云,徐美佳,孙效文. 2009
[7]低温胁迫对鲤血清生化指标的影响. 常玉梅,曹鼎臣,孙效文,梁利群. 2006
[8]鲤鱼cDNA-AFLP技术反应体系的建立. 李飞,贾智英,闵霞,石连玉. 2011
[9]液相色谱串联质谱测定磺胺间甲氧嘧啶与鲤鱼血浆蛋白结合率. 孙言春,王瑛,杜宁宁,吴松,牟振波,汤施展. 2012
[10]利用EST-SSR座位对鲤鱼几种生长性状的单标记回归分析. 徐美佳,张研,鲁翠云,张晓峰,刘继红,孙效文. 2009
[11]丁香油对鲤鱼和罗非鱼的麻醉作用. 梁政远,安丽娜,缪凌鸿,徐跑,董在杰. 2009
[12]四个鲤鱼种群遗传多样性的AFLP分析. 钟立强,张成锋,周凯,李冰,王建新,朱健. 2010
[13]鲤鱼(CYPRINUS CARPIO)体细胞系的建立及其生物学特性分析(简报). 孟凡华,尹洪滨,孙中武,陈维多. 2005
[14]不同浓度铬盐饲料对鲤生长和血浆生化指标的影响. 蔺玉华,卢健民,富惠光,梁智龙,赵淑敏,马俊杰. 2003
[15]饥饿和重摄食对鲤鱼脂蛋白脂肪酶活性的影响. 王钦,李建林,唐永凯,李红霞,吴钧晟,张磊,沈泽恩,俞菊华. 2019
[16]不同浓度阿维菌素对鲤鱼过氧化氢酶和谷胱甘肽-S-转移酶活性的影响. 陈家长,杨光,孟顺龙,马晓燕,胡庚东. 2010
[17]2种多糖对鲤鱼离体培养免疫细胞活性的影响. 曹丽萍,丁炜东,张柳,Galina Jeney,殷国俊. 2008
[18]鱼类同工酶电泳方法的改进. 葛彦龙,尹洪滨,石连玉,孙效文. 2010
[19]应用荧光标记通用引物检测鲤鱼(Cyprinus Carpio)微卫星基因型. 常玉梅,高国强,韩启霞,池炳杰,梁利群. 2010
[20]鲤鱼PLA2g3a1催化活性区的原核表达及酶活性分析. 王钦,李建林,唐永凯,李红霞,张磊,沈泽恩,俞菊华. 2020
作者其他论文 更多>>
-
鲤PPARγ基因序列特征及其与脂肪沉积的相关性
作者：周佳;刘天奇;孙志鹏;吉宇丹;鲁翠云;曹顶臣;郑先虎
关键词：鲤;PPARΓ基因;基因表达;脂肪沉积
-
基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构
作者：鲁翠云;孙志鹏;曹顶臣;耿龙武;那荣滨;吴学工;郑先虎
关键词：梭鲈;线粒体COⅠ基因;野生群体;遗传结构
-
乌苏里江饶河段鱼类的早期资源及其产卵场位置推测
作者：刘嘉成;王继隆;李培伦;鲁翠云;张辉
关键词：乌苏里江;鱼类早期资源;种类组成;环境因子;典范对应分析
-
雅罗鱼杂交种及其双亲耐碱性能相关生理指标比较
作者：李雯;艾克达·热合曼;邹宇婷;黄晶;张立民;常玉梅
关键词：雅罗鱼;杂交种;耐碱性能;渗透压调节;氨代谢
-
瓦氏雅罗鱼3个养殖群体种质差异分析
作者：艾克达·热合曼;黄晶;邹宇婷;张立民;常玉梅
关键词：瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii);抗氧化酶活性;肌肉营养成分;遗传多样性
-
梭鲈快速生长品系F3基因型与生长性状关联分析
作者：潘亚丹;鲁翠云;孙志鹏;刘天奇;张渴新;郑先虎
关键词：梭鲈;基因型;生长性状;关联分析
-
黑龙江流域草鱼养殖群体种质特征
作者：王瑞;鲁翠云;孙志鹏;刘天奇;常玉梅;刘鹏;曹庆;郑先虎
关键词：草鱼;形态性状;肌肉营养成分;酶活性;单核苷酸多态性
