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玉米DIR基因家族的全基因组鉴定及ZmDIR17基因在籽粒发育中的功能解析

文献类型: 中文期刊

作者: 秦涛 1 ; 王慧 1 ; 赵志雄 1 ; 申龙斌 2 ; 史亚兴 3 ; 卢柏山 3 ; 施标 4 ; 郑洪建 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院作物育种栽培研究所

2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

3.北京市农林科学院玉米研究所

4.CIMMYT-中国特用玉米研究中心

关键词: 玉米;DIR基因家族;ZmDIR17基因;籽粒发育

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2025 年 41 卷 003 期

页码: 1-15

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: DIR(Dirigent)基因家族在植物生长发育与逆境响应中具有重要功能,但其在玉米中的系统性鉴定尚未有相关研究。本研究通过全基因组分析,在玉米B73-V4参考基因组中鉴定到39个DIR基因家族成员,并系统解析其理化性质、结构特征及保守基序。结果表明:77.0%(30个)的ZmDIR蛋白具有高稳定性,64.1%(25个)的ZmDIR蛋白具有疏水性。亚细胞定位预测显示:11个ZmDIR蛋白定位于叶绿体中,10个定位于内质网中,8个定位于细胞质中,只有5个定位于液泡中,说明玉米的DIR蛋白存在多样化的生物学功能。进化分析表明:ZmDIR基因可分为3个亚家族,其启动子区域包含多样化的逆境响应元件及系统发育相关响应元件。围绕ZmDIR17基因进行功能解析,发现其突变导致玉米籽粒形态发生显著改变,且玉米籽粒蛋白质含量显著增加,淀粉和总木脂素含量明显降低。蛋白互作网络与GO富集分析表明,ZmDIR17蛋白通过参与核糖体生物发生(互作Pescadillo同源蛋白)和苯丙烷代谢(调控木脂素合成)双重通路协调碳氮分配。本研究揭示了玉米DIR基因家族的系统特征,并初步探索了ZmDIR17基因及其编码蛋白通过整合初级与次生代谢调控籽粒发育的分子机制,可为玉米品质改良提供新的参考。

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