文献类型： 中文期刊
作者： 郑俊斌 1 ; 张凤英 1 ; 马凌波 1 ; 陆亚男 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院东海水产研究所
关键词： 米氏凯伦藻;核糖体18S rDNA;转录间隔区;系统进化;分子鉴定
期刊名称： 上海海洋大学学报
ISSN： 1674-5566
年卷期： 2009 年 18 卷 06 期
页码： 680-685
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 对赤潮多发藻米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)核糖体18S rDNA及其转录间隔(ITS)区序列PCR扩增并测序,获得18S rDNA和ITS基因序列长度分别为1 690 bp和654 bp。结合12种甲藻和1种硅藻作序列比较分析,分别在ITS1、ITS2序列寻找到适宜设计特异性引物探针区域,并用邻接法构建系统进化树,研究各藻种间亲缘关系。遗传距离分析结果显示米氏凯伦藻与短凯伦藻(Karena brevis)、微小卡罗藻(Karlodinium micrum)等分类学上较近的藻种18S rDNA序列相似度为97%~99%,远大于微小原甲藻(Prorocentrum minimum)、海洋原甲藻(P.micans)、塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarense)等在分类学上相距较远的藻种,各藻种间的ITS序列平均相似度明显低于18S rDNA序列。以18S rDNA与ITS序列构建的进化树拓扑结构相一致,18S rDNA序列相对保守,适合进行属以上关系的系统进化分析,而ITS序列变异较大,适合种属间鉴别分析,且ITS1和ITS2是变异很大的区域,适合种间的分子特异性鉴定,这为快速鉴别赤潮多发藻米氏凯伦藻提供了依据,进而为治理赤潮提供帮助。
- 相关文献
[1]环介导恒温扩增技术快速检测米氏凯伦藻方法的建立. 张凤英,徐兆礼,马凌波,郑俊斌,缪宇平,陆亚男. 2009
[2]两种常见外来入侵赤潮藻的PCR鉴定. 郑俊斌,张凤英,马凌波,陆亚男,马春艳. 2009
[3]pH对米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)种群生长、营养吸收及无机碳亲和力的影响. 王越,沈盎绿,赵世烨,朱礼鑫,宋淑贞,李道季. 2015
[4]几种帘形目贝类RDNA ITS序列的比较. 刘相全,包振民,胡景杰,王师,方建光,王如才. 2007
[5]米氏凯伦藻生长对磷的响应及其吸收动力学研究. 周钦,马增岭,袁兴伟,沈盎绿. 2017
[6]东海米氏凯伦藻水华中中华哲水蚤的选择性摄食. 孙军,宋书群,徐兆礼,王宗灵,朱明远. 2007
[7]不同营养盐水平对东海原甲藻和米氏凯伦藻生长的影响. 沈盎绿,李道季. 2016
[8]基于12SrRNA序列研究龟鳖类的系统进化特征. 万全,郑将臣,程起群,赵金良. 2010
[9]利用线粒体序列分析黑龙江和松花江流域乌苏里拟鲿种群遗传结构. 吴静,张研,霍堂斌,孙效文. 2013
[10]Magnetospira sp.QH-2 MamK蛋白的结构和系统进化分析. 滕兆洁,张文燕,刘佳,董逸,陈一然,潘红苗,杜海舰,王明玲,徐丛,肖天. 2016
[11]基于COⅠ基因序列的长腹剑水蚤系统进化关系. 王兴霞,徐磊,王亮根,陈骁,郑媛媛,王雪辉,杜飞雁. 2018
[12]中国绥芬河三块鱼不同群体的种属划分及起源. 常玉梅,程磊,孙博,苏宝锋,梁利群,王维坤. 2018
[13]北京周边山地苔草属和委陵菜属植物功能性状. 李丹. 2013
[14]中国近海习见头足类DNA条形码及其分子系统进化. 王鹤,林琳,柳淑芳,姜志强,庄志猛. 2011
[15]脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)3个野生群体mtDNA 16S rRNA序列差异及长臂虾科系统进化关系. 马朋,刘萍,李健,李吉涛,高保全. 2012
[16]军曹鱼淋巴囊肿病毒主衣壳蛋白基因全序列分析. 付小哲,石存斌,李宁求,潘厚军,常藕琴,吴淑勤. 2007
[17]脊尾白虾3个野生群体ITS1序列分析及其亲缘关系分析. 马朋,刘萍,李健. 2012
[18]七鳃鳗属3种类的亲缘关系分析. 常玉梅,黄晶,孙博,苏宝锋,梁利群. 2018
[19]基于形态特征和线粒体16S rRNA基因序列探讨棱鳀属的系统进化. 马春艳,马凌波,倪勇,沈盎绿,张永. 2010
[20]3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化. 张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳. 2008
作者其他论文 更多>>
-
不同饵料对拟穴青蟹大眼幼体变态发育的影响
作者：乔光德;马春艳;张凤英;王伟;赵明;谌微;傅愔;刘志强;马凌波
关键词：饵料;拟穴青蟹;大眼幼体;变态发育
-
日本渔业主要问题及其水产政策改革分析
作者：沈映君;刘勤;余丽萍;高凌;王茜;陆亚男
关键词：日本渔业;日本水产政策;日本渔业法;政策建议
-
拟穴青蟹对盐度变化的生态适应及渗透调节机制研究进展
作者：傅愔;马凌波;成永旭
关键词：拟穴青蟹(Scylla paramamosain);盐度变化;生态适应;渗透调节;生长发育
-
鳗鲡产业发展现状及日本鳗鲡列入《濒危野生动植物种国际贸易公约》的影响分析
作者：刘勤;陆亚男;赵峰;姜婷
关键词：鳗鲡产业;欧洲鳗鲡;日本鳗鲡;濒危野生动植物种国际贸易公约
-
变废为宝、"医"食无忧之海鞘篇
作者：田晓清;樊成奇;陆亚男;李圣法
关键词：
-
饥饿胁迫对拟穴青蟹大眼幼体的比较转录组分析
作者：胡伟胜;王伟;马凌波;张凤英;刘志强;赵明;马春艳
关键词：拟穴青蟹;大眼幼体;饥饿;转录组
-
南极曲霉Aspergillus niger NJ49次级代谢产物的分离与鉴定
作者：陈莎;田晓清;樊成奇;李崇彬;陆亚男
关键词：南极真菌;曲霉;次级代谢产物;结构鉴定
