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香蕉α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶基因家族全基因组鉴定与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 董晨 1 ; 胡会刚 1 ; 贾利强 1 ; 决登伟 1 ; 赵秋芳 1 ; 陈宏良 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树分子生物学重点实验室

关键词： 香蕉(Musa nana Lour.);α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶;生物信息;基因家族;进化分析

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2016 年 55 卷 12 期

页码： 3200-3204

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究香蕉(Musa nana Lour.)α-1,4-葡聚糖淀粉磷酸化酶(α-1,4-glucan starch phosphorylase,PHS)基因家族的特征和功能,利用生物信息学方法对香蕉PHS家族进行了全基因组查找、鉴定及相关分析。结果表明,在香蕉中共鉴定出2个成员,Ma PHS1的开放阅读框长度为2 784 bp,编码927个氨基酸,分子质量为104.8 ku,等电点为6.59;Ma PHS2的开放阅读框长度为2 517 bp,编码838个氨基酸,分子质量为95.09 ku,等电点为6.09。Ma PHS1和Ma PHS2分别含有17个和15个外显子;Ma PHS1和Ma PHS2均含有淀粉磷酸化酶的保守性基序,进化过程中比较保守。

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