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小麦TaPHYA基因亚家族的克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王霞 1 ; 马燕斌 2 ; 宋梅芳 2 ; 孟凡华 2 ; 李秀全 2 ; 杨丽 2 ; 吴霞 3 ; 杨克诚 4 ; 杨建平 2 ;

作者机构: 1.运城学院生命科学系

2.中国农业科学院作物科学研究所

3.山西省农业科学院棉花研究所

4.四川农业大学玉米研究所

关键词: 小麦;光敏色素A;组织特异性;表达分析

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2012 年 38 卷 08 期

页码: 1354-1360

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 光敏色素是一类与作物农艺性状密切相关的基因家族。本研究克隆了中国春小麦光敏色素TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3基因完整的编码序列,并对它们进行了生物信息学以及转录分析。在NCBI数据库中对其推测的氨基酸序列进行BLAST分析,发现TaPHYA1和TaPHYA3氨基酸序列中包含光敏色素基因完整的功能结构域。系统进化树分析表明,小麦TaPHYA1、TaPHYA2和TaPHYA3之间进化关系相近,且与单子叶植物玉米、水稻的PHYA聚为一个亚类。另外,TaPHYA的表达丰度具有组织特异性,在茎、叶、穗中表达量分别是根中的1.35、0.34和0.87倍;而在同光质条件下,其表达丰度也具有光质特异性,TaPHYA的总表达量在黑暗和远红光条件下最高,在蓝光条件下次之,而红光和白光条件下最低。该结果为深入研究小麦光敏色素A基因亚家族的功能奠定了基础。

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