文献类型: 中文期刊
作者: 齐香玉 1 ; 陈双双 1 ; 冯景 1 ; 王华娣 2 ; 邓衍明 1 ;
作者机构: 1.江苏省农业科学院休闲农业研究所江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室
2.江苏大学生命科学学院
关键词: 茉莉花;qRT-PCR;内参基因;表达稳定性
期刊名称: 华北农学报
ISSN: 1000-7091
年卷期: 2020 年 006 期
页码: 22-30
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为筛选适合茉莉花的内参基因,以5种组织(根、茎、嫩叶、成熟叶、花)和4个发育阶段的花(幼蕾期、膨大花蕾期、最长花蕾期和初绽期)为试验材料,选择较常见的8个候选内参基因进行引物特异性分析,结果显示,8个内参基因均扩增出单一条带,溶解曲线均只有明显的单一峰。采用qRT-PCR技术分析8个内参基因在不同样品中的表达量,结果显示,内参基因在不同样品中的表达量存在差异,各基因在花中的表达量均显著低于其他样品。利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件对基因的表达稳定性进行评价,并通过RefFinder对表达稳定性进行综合分析,结果表明,适用于不同组织(有花组)的最优内参基因为SAND和UPL7;适用于不同组织(无花组)的最优内参基因为UPL7和GAPDH;而适宜不同发育阶段花的最优内参基因为Actin和EF1α。进一步利用JsDXS和JsPAL2对筛选的内参基因进行验证,结果显示,以稳定性好的Actin、EF1α及Actin+EF1α组合为参照时,JsDXS和JsPAL2在花发育不同阶段的表达水平的变化趋势基本一致,而用最不稳定的PP2A为参照时,花发育不同阶段的表达水平的变化趋势不一致。总之,本研究对茉莉花内参基因进行了筛选,不同组织(有花组)的最优内参基因为SAND和UPL7;不同组织(无花组)的最优内参基因为UPL7和GAPDH;花发育不同阶段的最优内参基因为Actin和EF1α。
- 相关文献
[1]铝处理下绣球实时荧光定量PCR内参基因筛选及验证. 陈双双,齐香玉,冯景,陈慧杰,王华娣,秦紫艺,邓衍明. 2021
[2]荷花淹水胁迫下实时定量PCR内参基因的验证. 徐君,江君,王欢,姜红卫. 2019
[3]外部因素对茉莉生长发育的影响研究进展. 邓衍明,齐香玉. 2019
[4]茉莉花文化挖掘及其在休闲农业中的应用探讨. 邓衍明,齐香玉,陈双双,冯景. 2019
[5]茉莉生殖发育与分子生物学特性研究分析. 邓衍明,齐香玉,苏家乐. 2019
[6]茉莉花TCP基因家族全基因组鉴定及其表达分析. 齐香玉,李新茹,陈双双,冯景,陈慧杰,金玉妍,苗艳华,邓衍明. 2024
[7]早熟砂梨‘苏翠1号’与其亲本‘翠冠’‘华酥’成熟果实差异代谢产物及差异基因比较分析. 王宏,杨王莉,蔺经,杨青松,李晓刚,盛宝龙,常有宏. 2022
[8]辣椒细胞质雄性不育相关基因的克隆与表达分析. 刘科伟,王述彬,刁卫平,戈伟. 2017
[9]辣椒胞质雄性不育相关基因的克隆及表达. 王述彬,刁卫平,刘金兵,潘宝贵,戈伟,郭广君. 2014
[10]猪骨骼肌荧光定量PCR内参基因稳定性分析. 齐富磊,林勇,杨铭洋,邓康泥,黄媛琴,徐稳,周小兵,丁沛,贾逸敏. 2020
[11]银杏实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择与验证. 苏西娅,石元豹,杨晓明,汪贵斌,曹福亮. 2019
[12]栝楼实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证. 束红梅,徐筋燕,何晓兰,郭书巧. 2022
[13]喀西茄内参基因实时荧光定量PCR表达稳定性评价. 周晓慧,刘军,庄勇. 2014
[14]脊尾白虾GAPDH基因的克隆及其内参基因稳定性分析. 张培,李志辉,赵莲,赖晓芳,高焕,李健,阎斌伦. 2017
[15]紫花苜蓿18S rRNA基因的克隆及内参基因表达稳定性评价. 付媛媛,穆春生,高洪文,李俊,王学敏. 2014
[16]番茄qRT-PCR内参基因的筛选. 姜静,王银磊,赵丽萍,周蓉,李亚茹,赵统敏,余文贵. 2017
[17]徐香猕猴桃RNA提取条件及内参基因的优化. 赵素平,胡博然,胡花丽,周宏胜,刘红艳,李鹏霞. 2017
[18]Computational identification of microRNAs in strawberry expressed sequence tags and validation of their precise sequences by miR-RACE. Han, Jian,Yu, Hua-Ping,Wang, Chen,Liu, Hong,Fang, Jing-Gui,Dong, Qing-Hua,Ge, An-Jing,Zhao, Mi-Zhen.
[19]Computational identification of microRNAs in peach expressed sequence tags and validation of their precise sequences by miR-RACE. Zhang, Yanping,Yu, Huaping,Han, Jian,Song, Changnian,Fang, Jinggui,Yu, Mingliang,Ma, Ruijuan.
[20]Characterization of miRNAs responsive to exogenous ethylene in grapevine berries at whole genome level. Zhao, Fanggui,Wang, Chen,Han, Jian,Zhu, Xudong,Li, Xiaopeng,Fang, Jinggui,Zhao, Fanggui,Wang, Xicheng.
作者其他论文 更多>>
-
不同绣球品种耐寒性评价及主要指标筛选
作者:陈慧杰;严子桢;齐香玉;陈双双;冯景;金玉妍;苗艳华;邓衍明
关键词:绣球;耐寒性;低温半致死温度(LT50);相关性分析;主成分分析
-
大叶绣球艾薇塔组培快繁技术
作者:陈双双;秦紫艺;邱帅;冯景;高凯;齐香玉;陈慧杰;邓衍明
关键词:大叶绣球;艾薇塔;组织培养;快速繁殖
-
绣球花铝转运蛋白HmALMT11的生物信息学及其表达特性分析
作者:王晓玥;陈双双;齐香玉;冯景;陈慧杰;孙明;邓衍明
关键词:绣球花;ALMT;铝胁迫;生物信息学分析;亚细胞定位;实时荧光定量PCR
-
杜鹃花新品种'蝶海'
作者:李畅;刘晓青;邓衍明;苏家乐;周惠民;孙晓波;郭臻昊
关键词:杜鹃花;地栽;品种
-
茉莉花TCP基因家族全基因组鉴定及其表达分析
作者:齐香玉;李新茹;陈双双;冯景;陈慧杰;金玉妍;苗艳华;邓衍明
关键词:茉莉花;TCP基因家族;全基因组鉴定;系统进化分析;表达分析
-
钢渣混合基质对大花绣球扦插生根的影响
作者:毛俊丹;陈慧杰;齐香玉;陈双双;冯景;金玉妍;邓衍明;张浩
关键词:钢渣;绣球花;扦插生根;混合基质;固废
-
杜鹃花新品种‘香妃玉’
作者:李畅;邓衍明;苏家乐;周惠民;孙晓波;郭臻昊;刘晓青
关键词:杜鹃花;盆栽;品种