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百脉根WRKY基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马培杰 1 ; 李亚娇 1 ; 舒健虹 1 ; 王小利 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院草业研究所

关键词： 百脉根;WRKY;基因家族

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2023 年 014 期

页码： 4606-4617

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY转录因子是一个超家族的调节因子，参与植物的多种生物过程和逆境胁迫反应。然而，在百脉根中对WRKY家族还没有相关的研究。本研究共鉴定出79个LjWRKYs基因，它们不均匀分布在各染色体上的基因位点编码，与拟南芥At WRKYs进行系统发育分析，分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类。保守基序和外显子-内含子数目表明79个LjWRKYs在不同亚簇中均具有较大的差异，顺式作用元件结果显示在上游2 000 bp启动子区域包含多种逆境胁迫、激素和生长发育相关的元件。共线性结果有36对片段复制和1对串联重复复制共线性基因，且Ka/Ks均小于1。本研究通过分析百脉根WRKY基因家族的基本结构与性质，为深入研究百脉根WRKY基因家族提供了基础。

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[2]WRKY转录调控因子在植物与病原体互作中的功能. 伍林涛,万谦,韩宏仕,奉斌,康公平,曾章丽. 2014

[3]菌株对百脉根及百脉根促生效果测定的研究. 付薇,杨春燕,陈伟,李显刚,陆瑞霞,舒建虹. 2015

[4]干旱胁迫对百脉根叶绿素荧光特性的影响. 赵丽丽,王普昶,陈超,刘洪来,马林. 2014

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[10]百脉根PIN基因家族的鉴定与分析. 吕赟,丘日光,杨仕梅,吴佳海,宋莉. 2019

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