文献类型： 中文期刊
作者： 董晨 1 ; 魏永赞 1 ; 王弋 1 ; 郑雪文 1 ; 李伟才 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所农业部热带果树生物学重点实验室
关键词： 荔枝(Litchi chinensis);木葡聚糖内切葡聚糖酶/水解酶;基因家族;生物信息分析;表达分析
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2019 年 012 期
页码： 3865-3873
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了研究木葡聚糖内切葡聚糖酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase, XTH)基因家族在荔枝花穗发育过程中的分布及表达情况,本研究基于'妃子笑'荔枝花穗转录组数据,利用生物信息学研究方法,首次对'妃子笑'荔枝XTH基因家族进行鉴定,包括基因的基本物理和化学特征,亚细胞定位,蛋白质保守结构域,进化关系和表达模式.结果表明:Lc XTH基因家族成员有29个,其蛋白长度范围在37~311 AA之间,对应的相对分子量范围在4.398~35.711 k D之间,等电点(pI)范围为4.39~9.46.此外,亚细胞定位分析显示所有LcXTH蛋白均位于细胞壁;Lc XTH含有2个相对保守的结构域(Glycohydro16结构域和XETC结构域);系统发育树分析表明LcXTH基因家族分为四组(Ⅰ~Ⅳ组),不同发育阶段LcXTHF基因的表达模式不同.本研究为进一步对XTH基因的功能研究提供理论依据.
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