文献类型： 中文期刊
作者： 李新凤 1 ; 王建明 1 ; 姜晓东 1 ; 郝晓娟 1 ; 张祖维 1 ; 田宏先 1 ;
作者机构： 1.山西农业大学农学院;山西农业大学动物科技学院;山西省农业科学院高寒区作物研究所
关键词： 拟轮枝镰孢菌;EST-SSR;信息分析;遗传多样性;通用性
期刊名称： 植物保护学报
ISSN： 0577-7518
年卷期： 2018 年 04 期
页码： 819-826
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为开发可用于拟轮枝镰孢菌Fusarium verticillioides及其近缘种遗传多样性分析的SSR引物,利用生物信息学方法和PCR技术,通过对从NCBI下载的87 086条拟轮枝镰孢菌的EST序列信息进行分析,设计EST-SSR引物,检测其在拟轮枝镰孢菌及其近缘种中的扩增情况,并用筛选出的多态性引物对15株拟轮枝镰孢菌进行SSR遗传多样性分析。结果表明,在EST序列中,共查找到11 952个SSR位点,592种重复基元,SSR出现频率为1.09%,重复基元出现数量最多的为三核苷酸(54.00%),其中(CAA/TTG)n基元出现频率最高。设计的25对EST-SSR引物在拟轮枝镰孢菌种内的有效扩增率和多态率分别为80.00%与32.00%,对5种近缘镰孢菌种的通用率和多态率分别为40.00%和8.00%。遗传多样性分析结果表明,在相似系数为0.664水平下,供试菌株可划分为4个SSR类群,但类群的划分与菌株的地理来源无关;不同菌株间存在明显的遗传分化。表明基于拟轮枝镰孢菌EST序列开发的SSR引物可用于拟轮枝镰孢菌及其近缘种的遗传多样性分析。
- 相关文献
[1]尖镰孢菌EST-SSR遗传多样性分析及通用性评价. 李新凤,王建明,张作刚,郝晓娟,张祖维,田宏先. 2015
[2]药用植物苦参EST-SSR标记的开发及DNA指纹图谱的构建. 段永红,雷海英,张旭,吴玉香,孙毅. 2018
[3]基于信息分析的俄罗斯矿区土地复垦研究. 冀宪武,赵永胜,陈晓冬,郜春花,张强. 2013
[4]棉花非冗余性EST-SSR新标记的开发及其评价. 王为,王长彪,刘方,陈浩东,王琳,王春英,张香娣,王玉红,王坤波. 2012
[5]Development of EST-SSR markers related to salt tolerance and their application in genetic diversity and evolution analysis in Gossypium. B.H. Wang,P. Zhu,Y.L. Yuan,C.B. Wang,C.M. Yu,H.H. Zhang,X.Y. Zhu,W. Wang,C.B. Yao,Z.M. Zhuang,P. Li. 2014
[6]黍稷EST-SSR标记的开发. 商春悦,王蓉,王海岗,陈凌,Santra Dipak K,乔治军,王瑞云. 2022
[7]苦荞SRAP分子标记体系优化与遗传多样性分析. 令狐斌,侯思宇,孙朝霞,黄可盛,路阳,韩渊怀,许冬梅. 2015
[8]基于SSR的中国糜子遗传多样性分析. 季煦,王瑞云,曳水瑛,刘晓欢,杨阳,刘笑瑜,连帅. 2015
[9]37份洋葱遗传多样性的RAPD和SSR分析. 翟亚辉,马蓉丽,成妍,吴海涛,张光星. 2013
[10]枣树不同品种遗传多样性的RAPD分析. 贺润平,渠云芳,雷海英. 2010
[11]锦鸡儿属植物遗传多样性的RAPD分析. 段永红,牛西午,李素清,孙毅. 2009
[12]大豆种质资源遗传多样性研究进展. 何真,韵晓东,武凯,姬虎太,常建忠,乔麟轶,郑军. 2015
[13]苦叶七种质资源的随机扩增多态性DNA分析. 樊冬丽,牛西午,马小军,肖小河,鄢丹,廖庆文. 2006
[14]燕麦种质资源在晋北寒旱生态区的鉴定. 李岩,李荫藩,马大炜,梁秀芝,薛龙飞,李刚. 2015
[15]基于表型性状和SSR标记的山西省青狗尾草资源遗传多样性分析. 张耀元,任彦鑫,禾璐,张雁明,张彬,王兴春,李红英,韩渊怀. 2016
[16]线辣椒种质资源遗传多样性分析. 武国平,赵尊练,叶新华,谢振华,史联联,郭建伟. 2014
[17]山西省绿豆种质资源的遗传多样性分析. 朱慧珺,张耀文,赵雪英,张泽燕,闫虎斌,张春明. 2019
[18]糜子EST-SSR分子标记的开发及种质资源遗传多样性分析. 何杰丽,石甜甜,陈凌,王海岗,高志军,杨美红,王瑞云,乔治军. 2019
[19]山西谷子核心资源群体结构及主要农艺性状关联分析. 王海岗,温琪汾,穆志新,乔治军. 2019
[20]山西省小麦育成品种遗传多样性分析. 郑军,李晓华,赵佳佳,尚保华,曹勇,马小飞,张晓军,乔玲,乔麟轶,郑兴卫,张建诚. 2018
作者其他论文 更多>>
-
尖孢镰孢菌与番茄互作早期milRNA调控功能研究
作者：畅引东;贾仡伟;何瑞;张萌;孟广军;李新凤;张作刚;王建明
关键词：microRNA-like RNA;初级milRNA;蛋白互作网络;尖孢镰孢菌;靶基因
-
山西玉米丝黑穗病菌SSR遗传多样性与群体结构分析
作者：李新凤;尉天春;王雪梅;姜晓东;杨俊伟;冯铸;王建明
关键词：玉米丝黑穗病菌;SSR标记;遗传多样性;群体结构
-
不同种衣剂对华北大黑鳃金龟幼虫的防治效果及解毒酶活性的影响
作者：任美凤;董晋明;李大琪;畅建武;郝晓娟;陆俊姣
关键词：华北大黑鳃金龟;种衣剂;防治效果;解毒酶;红芸豆
-
镉胁迫对芥菜型油菜幼苗生理特性的影响
作者：湛润生;王莉;岳新丽;田宏先;王瑞霞
关键词：镉;芥菜型油菜;种子萌发;生理特性
-
春油菜光合作用及其相关生理特性对苗期干旱胁迫的响应
作者：田宏先;施毅;王瑞霞
关键词：芥菜型春油菜;晋油12号;怀仁大黄芥;干旱胁迫;形态指标;光合参数;隶属函数
-
晋北区春油菜间作亚麻栽培技术研究
作者：田宏先;王瑞霞;施毅;李小玉
关键词：晋北区;春油菜;间作;边际效应
-
胡麻脂氧合酶基因LuLOX1的克隆与表达分析
作者：姜晓东;杨建春;韩梅;谢冬微;李新凤;张春来
关键词：胡麻;脂氧合酶基因(LuLOX1);基因表达;脂氧合酶活性
