文献类型： 中文期刊

作者： 畅引东 ¹ ; 贾仡伟 ¹ ; 何瑞 ¹ ; 张萌 ¹ ; 孟广军 ¹ ; 李新凤 ¹ ; 张作刚 ¹ ; 王建明 ¹ ;

作者机构： 1.山西农业大学植物保护学院农业有害生物综合治理山西省重点实验室

关键词： microRNA-like RNA;初级milRNA;蛋白互作网络;尖孢镰孢菌;靶基因

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2022 年 006 期

页码： 102-112

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]MicroRNA通过调控其靶基因在生物活动中起到重要的作用，本研究目的是为了明确尖孢镰孢菌与番茄互作早期相关milRNAs的分子功能及调控机制。[方法]采用实时荧光定量PCR法对尖孢镰孢菌番茄专化型菌株侵染寄主早期pri-milRNAs和milRNAs靶基因进行基因表达分析，利用STRING蛋白互作网络数据库和Cytoscape软件预测该菌株milRNAs与靶基因间的蛋白互作网络，并结合DAVID在线分析工具对相关基因进行生物学功能分析。[结果]实时荧光定量PCR结果表明，供试的pri-milRNA＿2a和pri-milRNA＿2b与FOXG＿03470、pri-milRNA＿3b与FOXG＿04910、pri-milRNA＿4与FOXG＿08812、pri-milRNA＿6与FOXG＿00067表达趋势基本相反，4个miLRNA与相应基因可能存在靶标关系；蛋白互作网络预测结果可知，尖孢镰孢菌fox＿milRNA＿1、fox＿milRNA＿2、fox＿milRNA＿3和fox＿milRNA＿8的靶基因间互作较为紧密。其中，fox＿milRNA＿1的靶基因FOXG＿04240与fox＿milRNA＿2的靶基因FOXG＿03470能够同该蛋白互作网络中诸多的基因进行互作，推测为该蛋白互作网络中的枢纽基因；该蛋白互作网络主要分子功能为氧化还原酶活性，主要参与的生物学过程为小GTP酶介导的信号转导。fox＿milRNA＿3的靶基因FOXG＿04910可通过调节Rho基因影响菌株的生长，推断其和菌株与寄主的信号识别和菌株在寄主中定植有关。[结论]本研究通过试验验证和生物信息学预测发现，尖孢镰孢菌侵染番茄初期，存在milRNAs及其下游靶基因的调控网络。上述结果为进一步深入研究尖孢镰孢菌milRNA的功能提供一个新思路。