文献类型： 中文期刊

作者： 闫双勇 ¹ ; 谭振波 ² ; 刘学军 ¹ ; 苏京平 ¹ ; 马忠友 ¹ ; 孙林静 ¹ ; 卢百关 ³ ;

作者机构： 1.天津农作物研究所

2.北京大北农农业科技研究院

3.连云港市农科院

关键词： 水稻;抽穗期;侯选基因;单核苷酸多态性(SNP)

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2005 年 3 卷 03 期

页码： 335-341

收录情况： CSCD

摘要： 抽穗期是水稻的一种重要农艺性状,但其遗传控制机理还不清楚。本文利用数据库搜索的方法,搜索并分析了30个与拟南芥光周期调控途径花期控制基因同源的水稻基因。利用水稻多态性数据库,得到了发生在这些基因以及Hd6、Ehd1、OsSOC1上的820个SNP及191个InDel位点。分析表明,这些位点不是平均分布到每个基因上。SNP/InDel含量较高的基因存在SNP/InDel的热点片段。14.1%的SNP位点,及7%的InDel位点分布在基因的编码区。本文也分析了侯选基因侧翼5Kb范围内的SNP/InDel多态性位点。按照侧翼多态性位点数目的分布可以将侯选基因分成4种类型,即两侧保守型、两侧热点型、单侧热点型、一侧热点一侧保守型。