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妃子笑荔枝LcSAI启动子的克隆及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 董晨 1 ; 李金枝 1 ; 郑雪文 1 ; 王弋 1 ; 李伟才 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业农村部热带果树生物学重点实验室

关键词： 妃子笑荔枝;酸性转化酶基因;启动子;克隆;生物信息学;

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2022 年 003 期

页码： 25-30

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】酸性转化酶在荔枝糖代谢中具有重要作用，克隆和分析荔枝酸性转化酶基因（LcSAI）启动子，以期为LcSAI调控荔枝糖代谢的功能研究提供理论依据。【方法】以妃子笑荔枝果肉为材料，根据荔枝基因组序列信息，克隆LcSAI上游约1 500 bp的启动子序列，并利用生物信息学工具对启动子序列中的转录起始位点、顺式作用元件及CpG岛进行预测分析。【结果】克隆得到1 514 bp的LcSAI启动子序列，启动子顺式作用元件除了存在大量的启动子核心元件如TATA-box和增强元件CAAT-box外，还存在光响应顺式元件、激素应答元件、厌氧诱导响应元件、MYB结合位点、MYC结合位点及一些未知功能的顺式作用元件。LcSAI启动子序列可能存在3处核心启动子区域，LcSAI启动子区没有预测到符合限定条件的CpG岛。【结论】LcSAI基因启动子与逆境胁迫有关，推测酸性转化酶在荔枝抵御逆境胁迫的生理过程中具有重要作用。

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