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鹅多杀性巴氏杆菌OmpH的扩增与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵文娟 1 ; 康立超 1 ; 田亮 2 ; 薄新文 1 ; 马勋 1 ;

作者机构： 1.新疆农垦科学院／新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室

2.石河子大学动物科技学院

关键词： 多杀性巴氏杆菌;外膜蛋白H;二级结构;B细胞抗原表位;功能预测

期刊名称： 黑龙江农业科学

ISSN： 1002-2767

年卷期： 2012 年 02 期

页码： 16-21

摘要： 为扩增鹅多杀性巴氏杆菌OmpH基因,预测OmpH蛋白二级结构和B细胞抗原表位,通过PCR扩增测序及生物信息学分析技术对该基因序列进行开放阅读框(ORF)的寻找、编码氨基酸的推导及蛋白质二级结构的初步预测等,探讨了鹅多杀性巴氏杆菌OmpH基因在免疫保护中的作用。结果表明:鹅多杀性巴氏杆菌OmpH基因全长1537bp,ORF包含1056bp编码351个氨基酸;二级结构以无规则卷曲为主,有少量的α-螺旋和延伸带;推测OmpH蛋白有1个细胞黏附位点、3个糖基化位点。该研究为分析鹅多杀性巴氏杆菌外膜蛋白理化特性、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定了理论基础。

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