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基于SAMPL的一种微卫星筛选方法在中国明对虾中的尝试

文献类型： 中文期刊

作者： 张留所 1 ; 孔晓瑜 2 ; 喻子牛 2 ; 孔杰 3 ; 相建海 1 ;

作者机构： 1.中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室

2.中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室

3.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL);中国明对虾(Fenneropenaeuschinensis);微卫星

期刊名称： 海洋科学

ISSN： 1000-3096

年卷期： 2006 年 30 卷 02 期

页码： 1-4

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 微卫星的发展主要受限于微卫星及其旁侧特异引物区的分离,在中国明对虾(Fenner-openaeus chinensis)中建立了选择性扩增多态微卫星位点(SAMPL,selective amplified mic-rosatellite polymorphic loci)技术体系,并初步尝试了基于SAMPL的一种微卫星筛选方法。通过5′端锚定引物引入微卫星序列,对传统SAMPL技术加以改进并以期富集简单重复序列。从测序胶上随机选择5条SAMPL条带(分别命名为S11,S13,S14,S22,S24)克隆测序,大小分别为161,157,147,152,298。其中S11,S13,S14,S22四个片段两端引物分别为AFLP选择性引物和SAMPL引物,S13和S22含微卫星序列重复,S24两端引物均为传统的AFLP引物,在此片断中有一(AG)39重复。

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