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内蒙古白绒山羊编码HGT-Ⅰ型蛋白的特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵冰 1 ; 李玉荣 2 ; 尹俊 3 ; 李金泉 1 ; 梁涛 4 ;

作者机构： 1.内蒙古农业大学动物科学与医学学院

2.内蒙古畜牧科学院

3.内蒙古农业大学生物工程学院

4.内蒙古鄂尔多斯市杭锦旗家畜改良工作站

关键词： 绒山羊;表达序列标签;角蛋白关联蛋白

期刊名称： 畜牧与饲料科学

ISSN： 1572-5190

年卷期： 2004 年 25 卷 04 期

页码： 25-27

摘要： 对内蒙古白绒山羊毛囊兴盛期的表达序列标签(EST)进行生物信息学方法的分析,通过在Genbank核酸数据库的Blastn相似性检索后发现有22个ESTs与小鼠的HGTproteintypeIE5mRNA基因有很高的同源性,进一步地分析发现这22个ESTs可分为两种不同的序列。经ORF(开放读码框)的预测共编码2种不同的蛋白质。这2个蛋白质的氨基端和羧基端的氨基酸残基都十分得相似,其甘氨酸、酪氨酸的含量达到了71.93%,而苯丙氨酸的含量达到了10.18%。并对其进行了二级结构的预测,发现它们在二级结构上有着很高的相似性。这2个蛋白质家族成员与小鼠的HGT蛋白质在氨基酸的组成和结构上都有很高的保守性。

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