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芥菜SBP-box基因家族全基因组鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨巍 1 ; 赵丽芬 1 ; 杨娟 1 ; 唐兵 1 ; 付文苑 1 ; 王青青 1 ; 莫传园 1 ; 张宝会 1 ; 奥宁 1 ; 李裕荣 1 ; 李飞 1 ; 王天文 1 ; 邓英 1 ;

作者机构： 1.贵州省农业科学院园艺研究所;贵州省园艺工程技术研究中心;贵州大学农学院;安顺学院农学院

关键词： 芥菜;SBP-box转录因子;生物信息学;表达分析

期刊名称： 东北农业大学学报

ISSN： 1005-9369

年卷期： 2023 年 54 卷 008 期

页码： 1-16

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： SBP-box作为植物特有转录因子家族,广泛参与植物生长发育调控与响应逆境胁迫.从芥菜全基因组中鉴定SBP-box基因家族,分析家族成员理化性质、序列特征、互作调控网络、进化关系及表达模式.结果表明,芥菜SBP-box共包含58个成员,均含有1个保守SBP结构域,启动子区域含有多种非生物胁迫响应与激素响应的顺式作用元件,BjuSBP-microRNA-靶基因构建复杂的调控网络,参与有机物生物合成、RNA代谢过程调控、花器官发育、营养相变化、细胞代谢调节等生物学过程.在低温胁迫下,BjuSBP1a、BjuSBP1b、BjuSBP1e、BjuSBP4l、BjuSBP4m等基因显著上调表达,在光胁迫下,大多数家族基因表达受抑制,其中BjuSBP1a、BjuSBP9d在两种胁迫下均上调表达,推断其在芥菜非生物胁迫应激反应中发挥功能作用,可作为培育芥菜抗逆新品种候选基因资源.

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