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中国水仙水通道蛋白基因cDNA克隆、序列分析与表达

文献类型： 中文期刊

作者： 林江波 1 ; 王伟英 1 ; 邹晖 1 ; 戴艺民 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院甘蔗研究所

关键词： 中国水仙;水通道蛋白;基因克隆;蛋白质结构

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2011 年 26 卷 03 期

页码： 371-376

摘要： 以构建的中国水仙不同花期的抑制差减杂交文库(SSH)为基础,采用RACE及RT-PCR技术,分离克隆到1个水通道蛋白基因NtPIP1。此基因包含有一个867 bp完整阅读框架(ORF),编码288个氨基酸,分子量为30.68 kD,理论等电点为8.97。用生物软件对NtPIP1蛋白分析表明:NtPIP1含有6个跨膜区,由5个环相连,其中环A、C和E在细胞膜外,环B、D和蛋白的N、C末端都位于细胞膜内,N末端55个氨基酸,C末端9个氨基酸,具有MIP家族典型的保守氨基酸序列HINPAVTFG和2个NPA保守肽段。三级结构预测表明和菠菜(2b5fA)水通道蛋白结构相似。聚类分析表明:该蛋白与其他12个物种的PIP1类水通道蛋白同源性在91%以上,属于质膜水通道蛋白PIP1类。半定量RT-PCR分析结果表明:NtPIP1基因在盛花期中国水仙雌蕊中的表达量最高。

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