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牛病毒性腹泻病毒结构蛋白基因的克隆及其B细胞抗原表位的预测

文献类型： 中文期刊

作者： 何延华 1 ; 黄新 1 ; 薄新文 1 ; 钟发刚 1 ; 韩猛立 1 ; 陈南颖 1 ; 王新华 1 ;

作者机构： 1.新疆农垦科学院/新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室

关键词： 牛病毒性腹泻病毒;结构蛋白;B细胞表位;二级结构;反向疫苗学

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2012 年 49 卷 02 期

页码： 310-317

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】以免疫信息学和反向疫苗学为理论根据,应用生物信息学相关软件和方法,对BVDV结构蛋白(Structural Protein,SP)的二级结构的不同方面及其B细胞表位进行了预测,综合评价了BVDV结构蛋白的抗原特异性细胞表位,并计算出一些潜在的抗原位点。【方法】利用RT-PCR扩增法获得牛病毒性腹泻病毒结构蛋白序列,通过克隆、测序分析结构蛋白基因的基因组序列和蛋白序列,采用DNAStar Protean软件对结构蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行综合分析,并预测其B细胞的抗原表位分布。【结果】P14、gp48和gp53蛋白含有的细胞优势抗原表位较多,有的甚至有可能成为优势抗原表位或对优势抗原表位有协同作用。【结论】与已鉴定的B细胞抗原表位相比,试验所用方法预测的结果有较高的准确度,是一种较为先进的表位研究方法。

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