文献类型： 中文期刊
作者： 刘姣 1 ; 高志鹏 1 ; 周有祥 1 ; 杨洁 1 ;
作者机构： 1.湖北省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所
关键词： ATP结合盒;特征序列;进化;核苷酸结合域
期刊名称： 基因组学与应用生物学
ISSN： 1674-568X
年卷期： 2021 年 0Z1 期
页码： 2100-2108
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： ATP结合盒（ATP-binding cassette, ABC）蛋白家族普遍存在于原核生物和真核生物中,主要参与大量初级和次级代谢物质的运输。目前关于不同生物中该蛋白家族特征的综合报道较少。本研究对来自461种古细菌、细菌和真核生物的ABC蛋白家族进行系统分析,共发现27 797个ABC转运蛋白,且在不同生物体内普遍具有较高的拷贝数,表明其在生物体中具有重要作用。ABC转运蛋白的结构分析表明其特征序列Walker A、Walker B和Walker C在生物体内高度保守。ABC转运蛋白的系统发育分析揭示了其系统发生关系和功能之间的密切联系。同时,通过全基因组挖掘首次揭示了具有4个或6个核苷酸结合域（nucleotide-binding domains, NBDs）的非常规ABC转运蛋白,且越高等的生物体中的ABC转运蛋白具有更多的NBDs。此外,根据ABC转运蛋白在NBDs中的特征,本研究总结了4种NBDs的进化模式。本研究结果可为不同生物体中ABC的分布、ABC系统发育关系以及NBD和ABC的进化模式等研究提供参考。
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